More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0519 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  100 
 
 		 368 aa  748    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 383 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.93 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  43.17 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 350 aa  315  5e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  43.24 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  42.86 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  42.86 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  42.97 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  42.97 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  42.32 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  42.59 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  42.43 
 
 		 359 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  43.36 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  41.19 
 
 		 391 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  43.68 
 
 		 352 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.32 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 376 aa  292  8e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.78 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 		 362 aa  289  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  41.96 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.67 
 
 		 372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  45.16 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.77 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.77 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.48 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 367 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  42.28 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  43.9 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.71 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.21 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  42.22 
 
 		 374 aa  279  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.62 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.62 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  41.76 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.77 
 
 		 355 aa  275  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  40.86 
 
 		 366 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  40.16 
 
 		 384 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  41.42 
 
 		 360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.64 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  42.3 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.07 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.82 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.14 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  39.57 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  40.65 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.03 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.39 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  40.83 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  41.94 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 367 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 		 386 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  41.03 
 
 		 347 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  40.67 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1524  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1631  ABC transporter related  42.15 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  41.14 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  39.02 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  39.3 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  39.67 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.3 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  46.65 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  39.57 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  45.48 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.97 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1739  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.11345  hitchhiker  0.00063526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  41.48 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  41.76 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 		 369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  36.93 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  41.48 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  41.48 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 		 365 aa  269  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 		 355 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.87 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 		 368 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  42.99 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>