107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0512 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  100 
 
 
117 aa  241  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1760  DsrE family protein  59.83 
 
 
118 aa  157  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000400151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1814  DsrE family protein  59.83 
 
 
118 aa  157  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000375732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  39.82 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  37.61 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1952  DsrE protein  35.04 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0266729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1853  sulfur relay protein TusD/DsrE  35.04 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.0757641 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  37.62 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0132  DsrE family protein  33.33 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0699  sulfur relay protein TusD/DsrE  34.19 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.187846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2317  sulfur relay protein TusD/DsrE  34.19 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0228723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0040  DsrE protein  30.77 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.5054  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  29.91 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1704  DsrE family protein  30.7 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000786463  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  33.33 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1655  DsrE family protein  34.19 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2483  DsrE protein  31.62 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554665  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3939  DsrE family protein  33.04 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.246201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  29.57 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3762  sulfur transfer complex subunit TusD  27.34 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000491404  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2187  sulfur relay protein TusD/DsrE  30.65 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1287  DsrE family protein  31.82 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.517646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  29.57 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1103  DsrE family protein  27.97 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.520397  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  27.83 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  29.73 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4238  DsrE family protein  27.35 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.7809  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1635  sulfur transfer complex subunit TusD  26.98 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4554  sulfur transfer complex subunit TusD  27.05 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178436  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4654  sulfur transfer complex subunit TusD  25.78 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000614483  normal  0.0147781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3843  DsrE family protein  26.09 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  29.57 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3924  sulfur transfer complex subunit TusD  26.23 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000851286  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3681  sulfur transfer complex subunit TusD  26.23 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000326504  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0272  sulfur transfer complex subunit TusD  26.23 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0395  sulfur transfer complex subunit TusD  25.41 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0489  intracellular sulfur reduction protein DsrE  29.67 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.233677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0368  sulfur relay protein TusD/DsrE  25 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0368  sulfur transfer complex subunit TusD  25 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0265289  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3626  sulfur transfer complex subunit TusD  25.78 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000441818  hitchhiker  0.000993351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1821  DsrE-like protein  28.7 
 
 
117 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.115649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0325  dsrE-related protein  23.93 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1725  hypothetical protein  32.17 
 
 
126 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3662  DsrE family protein  23.93 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0438374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3261  DsrE family protein  27.83 
 
 
116 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4159  DsrE family protein  24.79 
 
 
119 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126919  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  28.07 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3964  DsrE family protein  23.93 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344086  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2206  DsrE family protein  26.27 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03196  hypothetical protein  25.78 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000210262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  29.03 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1331  intracellular sulfur oxidation protein DsrE  26.83 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4013  sulfur transfer complex subunit TusD  25.41 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0324388  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4066  DsrE family protein  23.93 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4041  DsrE family protein  23.93 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  27.83 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3541  sulfur transfer complex subunit TusD  25.78 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.84382e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3814  sulfur transfer complex subunit TusD  25.78 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  27.83 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  28.44 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  28.07 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03147  hypothetical protein  25.78 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000155048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3936  DsrE-like protein  25.89 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  19.13 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3719  sulfur transfer complex subunit TusD  25.78 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989311  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3756  sulfur transfer complex subunit TusD  26.56 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0264721  normal  0.126397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3647  sulfur transfer complex subunit TusD  26.56 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000127633  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3648  sulfur transfer complex subunit TusD  26.56 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3648  DsrE family protein  24.79 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0159221  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0296  DsrE family protein  24.79 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3844  DsrE family protein  24.79 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.782549  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3205  DsrE family protein  27.83 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3819  sulfur transfer complex subunit TusD  26.56 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000709397  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3833  sulfur transfer complex subunit TusD  24.59 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3126  DsrE family protein  24.58 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0781099  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2327  DsrE family protein  28.81 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2135  DsrE family protein  28.57 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293804  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  33.72 
 
 
272 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0949  hypothetical protein  28.85 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2349  putative sulfur oxidation protein DsrE  25.83 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0286329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3443  intracellular sulfur oxidation protein of DsrE family protein  28.23 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0125489  decreased coverage  0.0000256073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1894  DsrE family protein  32.94 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00060  sulfur transfer complex subunit TusD  25.41 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4198  DsrE family protein  25.64 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2110  DsrE family protein  26.98 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000251046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002294  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusD  26.23 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1925  sulfur transfer complex subunit TusD  27.38 
 
 
130 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2059  DsrE family protein  27.42 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0188592  hitchhiker  0.000335265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2165  DsrE family protein  26.98 
 
 
129 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000184958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  27.19 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  28.07 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  28.07 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  28.07 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.208944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>