16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0386 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0386  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1470  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.14 
 
 
142 aa  165  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0788  50S ribosomal protein L23  56.94 
 
 
148 aa  158  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1440  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1486  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0511385  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15080  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.21 
 
 
162 aa  150  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0704  hypothetical protein  45.77 
 
 
158 aa  146  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1205  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / pyrimidine dimer DNA glycosylase  50.35 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2949  hypothetical protein  47.18 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.134771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1958  hypothetical protein  48.59 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0746675  hitchhiker  0.00408107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3486  hypothetical protein  46.48 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2927  pyrimidine dimer DNA glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.76 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158188  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11900  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.52 
 
 
154 aa  133  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.97418  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00360  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.66 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0336  hypothetical protein  28.29 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.072829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0883  hypothetical protein  37.5 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.653329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>