More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0289 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  50.28 
 
 
777 aa  681    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  54.88 
 
 
747 aa  775    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  98.44 
 
 
749 aa  1417    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.51 
 
 
742 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  63.77 
 
 
762 aa  969    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.69 
 
 
757 aa  831    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  46.02 
 
 
740 aa  636    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  49.14 
 
 
749 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
758 aa  1549    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  48.25 
 
 
737 aa  683    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  46.94 
 
 
750 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.14 
 
 
751 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  49.05 
 
 
800 aa  705    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.33 
 
 
755 aa  1019    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  63.34 
 
 
755 aa  1003    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.35 
 
 
790 aa  762    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.39 
 
 
750 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  46.59 
 
 
741 aa  631  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.5 
 
 
758 aa  625  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  47.37 
 
 
757 aa  625  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  46.94 
 
 
874 aa  612  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.65 
 
 
748 aa  608  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  46.71 
 
 
760 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.68 
 
 
813 aa  585  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.16 
 
 
809 aa  581  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.36 
 
 
780 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.53 
 
 
737 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.34 
 
 
734 aa  522  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  42.84 
 
 
793 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  42.05 
 
 
738 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  42.69 
 
 
793 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  40.9 
 
 
745 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  38.83 
 
 
721 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  41.15 
 
 
721 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  41.14 
 
 
722 aa  481  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.77 
 
 
711 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  40.25 
 
 
708 aa  476  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  42.23 
 
 
701 aa  477  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  42.06 
 
 
714 aa  468  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  41.75 
 
 
717 aa  463  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.54 
 
 
757 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  38.72 
 
 
814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  37.6 
 
 
716 aa  442  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.72 
 
 
933 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.51 
 
 
497 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  39.35 
 
 
731 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.55 
 
 
1072 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  35.18 
 
 
685 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  36.32 
 
 
987 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.9 
 
 
756 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  37.29 
 
 
693 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  34.62 
 
 
733 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  34.62 
 
 
733 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  34.62 
 
 
733 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  34.79 
 
 
733 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.81 
 
 
746 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  36.36 
 
 
748 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  34.33 
 
 
733 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  33.85 
 
 
733 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  34 
 
 
733 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  35.91 
 
 
730 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.9 
 
 
724 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.28 
 
 
922 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  35.51 
 
 
737 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  35.34 
 
 
748 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.14 
 
 
731 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.14 
 
 
731 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.77 
 
 
762 aa  364  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.75 
 
 
1158 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  35.64 
 
 
748 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  35.98 
 
 
691 aa  360  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  34.53 
 
 
735 aa  360  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  34.75 
 
 
751 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  35.37 
 
 
779 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  33.33 
 
 
727 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  34.61 
 
 
751 aa  353  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  34.61 
 
 
751 aa  353  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  34.65 
 
 
731 aa  349  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.28 
 
 
1321 aa  346  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.65 
 
 
829 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.92 
 
 
1338 aa  343  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.18 
 
 
790 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  33.06 
 
 
737 aa  341  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.29 
 
 
772 aa  337  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  34.39 
 
 
931 aa  336  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 
766 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.8 
 
 
771 aa  333  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  35.64 
 
 
772 aa  332  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 
763 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
754 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  31.82 
 
 
819 aa  330  6e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  44.67 
 
 
914 aa  330  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  34.46 
 
 
778 aa  327  5e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  35.64 
 
 
743 aa  326  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
805 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  43.65 
 
 
915 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  34.16 
 
 
778 aa  325  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  35.94 
 
 
765 aa  324  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.04 
 
 
774 aa  324  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  33.28 
 
 
765 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>