266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0248 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 
311 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  59.15 
 
 
176 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  59.15 
 
 
179 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  54.88 
 
 
174 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  51.81 
 
 
175 aa  191  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  51.52 
 
 
176 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0813  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  52.73 
 
 
175 aa  186  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  57.14 
 
 
138 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0994  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  48.43 
 
 
178 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.588329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  41.33 
 
 
206 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  152  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  41.75 
 
 
213 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  38.62 
 
 
204 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  46.75 
 
 
180 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.27 
 
 
213 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.88 
 
 
223 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  43.41 
 
 
192 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  42.55 
 
 
192 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  48.32 
 
 
151 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.71 
 
 
202 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  41.71 
 
 
192 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  36.84 
 
 
205 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  41.18 
 
 
192 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  39.9 
 
 
210 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  41.27 
 
 
194 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  48.15 
 
 
143 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  48.15 
 
 
143 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.41 
 
 
203 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.86 
 
 
206 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  50.71 
 
 
145 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  49.62 
 
 
150 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  47.37 
 
 
145 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  50.75 
 
 
151 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  35.57 
 
 
202 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  40.96 
 
 
194 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  50.39 
 
 
131 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.51 
 
 
197 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  44.44 
 
 
141 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  43.8 
 
 
144 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  30.38 
 
 
272 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  42.97 
 
 
167 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  41.48 
 
 
168 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  41.48 
 
 
178 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  30.48 
 
 
271 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
167 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  38.57 
 
 
164 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
135 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  39.85 
 
 
161 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  38.64 
 
 
164 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  30.33 
 
 
265 aa  95.9  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  39.06 
 
 
160 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.14 
 
 
162 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  40.34 
 
 
173 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
161 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  36.43 
 
 
166 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  40.6 
 
 
205 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  34.29 
 
 
162 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 
163 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.04 
 
 
165 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  37.12 
 
 
155 aa  92.4  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  39.69 
 
 
155 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  36.15 
 
 
181 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  29.74 
 
 
283 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  42.02 
 
 
174 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  34.59 
 
 
166 aa  89.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  40.8 
 
 
138 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.65 
 
 
187 aa  89  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  33.59 
 
 
183 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  39.34 
 
 
162 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  39.13 
 
 
127 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  38.66 
 
 
163 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.23 
 
 
190 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  40.65 
 
 
127 aa  86.7  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  38.66 
 
 
153 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  39.13 
 
 
127 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  36.97 
 
 
153 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  37.12 
 
 
162 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  40.34 
 
 
153 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  42.57 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  33.87 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  38.28 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  40.16 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  32.03 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  36.13 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  37.96 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  37.82 
 
 
164 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  35.77 
 
 
234 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.96 
 
 
228 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  44.9 
 
 
162 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  39.66 
 
 
127 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  34.4 
 
 
138 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  33.08 
 
 
180 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.24 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.35 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.459295 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  40.16 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  35.11 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  34.35 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  30.53 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  37.8 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>