229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3433 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  100 
 
 
460 aa  903    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  94.81 
 
 
489 aa  780    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  47.8 
 
 
445 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  45.65 
 
 
438 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  45.65 
 
 
438 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  46.59 
 
 
442 aa  320  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  44.71 
 
 
434 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  44 
 
 
434 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  42.36 
 
 
446 aa  273  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  40.46 
 
 
445 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.4 
 
 
443 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  40.74 
 
 
444 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  39.77 
 
 
464 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  37.19 
 
 
447 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  36.96 
 
 
447 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.13 
 
 
446 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  39.63 
 
 
444 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  33.86 
 
 
440 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  34.09 
 
 
443 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  37.81 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  37.13 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  38.31 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  37.59 
 
 
447 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  33.88 
 
 
441 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  35.42 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.72 
 
 
424 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.3 
 
 
419 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.71 
 
 
419 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  30.25 
 
 
419 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  24.41 
 
 
419 aa  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.91 
 
 
447 aa  84  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.95 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  33.79 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.94 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.75 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  24.46 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  34.42 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.7 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.27 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.24 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  40.38 
 
 
307 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  29.52 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.52 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  29.71 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  29.72 
 
 
496 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.84 
 
 
465 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.69 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.33 
 
 
399 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  27.82 
 
 
339 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  24.66 
 
 
450 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.98 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  29.77 
 
 
339 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  38 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  25.56 
 
 
481 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  25.1 
 
 
243 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.53 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.76 
 
 
261 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.8 
 
 
421 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.35 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.39 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.65 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.38 
 
 
447 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  35.14 
 
 
784 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.96 
 
 
338 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.33 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.68 
 
 
261 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  31.87 
 
 
395 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  28.03 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  28.03 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.46 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.32 
 
 
342 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  34.39 
 
 
326 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  30.08 
 
 
339 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  30.08 
 
 
339 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  19.94 
 
 
435 aa  54.3  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  26.32 
 
 
336 aa  53.9  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46928  ferric reductase 2  29.05 
 
 
656 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000397828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.03 
 
 
321 aa  53.5  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  32.05 
 
 
351 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  30.23 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  30.23 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  30.23 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  30.23 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.03 
 
 
321 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.03 
 
 
321 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  30.23 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  24.61 
 
 
348 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  34.46 
 
 
320 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  30.82 
 
 
788 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.64 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  30.11 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.91 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.01 
 
 
339 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  29.12 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  26.98 
 
 
393 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.12 
 
 
321 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.38 
 
 
444 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  30.98 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  32.89 
 
 
318 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>