More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3324 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  668  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  99.7 
 
 
328 aa  665  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  76.43 
 
 
339 aa  466  1e-130  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  65.53 
 
 
328 aa  440  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  51.7 
 
 
328 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.17 
 
 
325 aa  328  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  52.13 
 
 
324 aa  327  1e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  52.67 
 
 
330 aa  328  1e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  50.78 
 
 
330 aa  327  1e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  51.05 
 
 
339 aa  327  2e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  50.94 
 
 
325 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.79 
 
 
330 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  50.75 
 
 
336 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  50.31 
 
 
326 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.17 
 
 
330 aa  321  9e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  48.64 
 
 
331 aa  319  4e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  51.18 
 
 
327 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.32 
 
 
328 aa  318  8e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  51.51 
 
 
324 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  51.34 
 
 
323 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  52.01 
 
 
355 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  49.54 
 
 
353 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.47 
 
 
328 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  48.33 
 
 
335 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  51.82 
 
 
335 aa  314  1e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  52.92 
 
 
360 aa  313  3e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  49.84 
 
 
335 aa  312  6e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  49.37 
 
 
314 aa  312  6e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  52.19 
 
 
335 aa  311  7e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  48.48 
 
 
358 aa  309  3e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  47.22 
 
 
332 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  47.04 
 
 
325 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49.66 
 
 
349 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  46.3 
 
 
331 aa  308  7e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  51.94 
 
 
333 aa  308  7e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  46.3 
 
 
331 aa  308  7e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  49.36 
 
 
327 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  48.82 
 
 
323 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  46.77 
 
 
332 aa  308  1e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  48.51 
 
 
335 aa  307  1e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.67 
 
 
330 aa  307  2e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.67 
 
 
330 aa  307  2e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  48.84 
 
 
331 aa  306  2e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  53.35 
 
 
334 aa  306  4e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  51.45 
 
 
345 aa  305  5e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  51.45 
 
 
345 aa  306  5e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  46.08 
 
 
325 aa  305  5e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  49.05 
 
 
336 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  49.66 
 
 
328 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  48.31 
 
 
323 aa  303  2e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  46.3 
 
 
327 aa  303  2e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  45.95 
 
 
318 aa  303  2e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  45.37 
 
 
324 aa  302  4e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  49.85 
 
 
339 aa  303  4e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.68 
 
 
327 aa  302  5e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.81 
 
 
334 aa  301  8e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  50.51 
 
 
325 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  46.03 
 
 
322 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  46.48 
 
 
356 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  50.51 
 
 
325 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  46.41 
 
 
334 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  46.69 
 
 
344 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  49.83 
 
 
330 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  46.83 
 
 
346 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  48.14 
 
 
336 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  49.33 
 
 
324 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  47.23 
 
 
335 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  48.5 
 
 
325 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  47.45 
 
 
318 aa  298  9e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  51.49 
 
 
333 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  48.16 
 
 
328 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  46.36 
 
 
337 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.06 
 
 
328 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  50 
 
 
310 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  46.83 
 
 
332 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  47.83 
 
 
325 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  46.33 
 
 
336 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  48.51 
 
 
329 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  48.84 
 
 
335 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  46.46 
 
 
343 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  45.06 
 
 
324 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  47.88 
 
 
346 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  48.04 
 
 
331 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.52 
 
 
326 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  47.39 
 
 
314 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.98 
 
 
331 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  48.99 
 
 
338 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.83 
 
 
335 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  44.24 
 
 
330 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.48 
 
 
323 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  43.81 
 
 
335 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  47.1 
 
 
324 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  48.15 
 
 
324 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 
322 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.15 
 
 
337 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  46.42 
 
 
348 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.49 
 
 
322 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.65 
 
 
330 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  50.5 
 
 
330 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>