More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3322 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  99.48 
 
 		 383 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  100 
 
 		 383 aa  765    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  59.84 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3886  thiolase  67.91 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  59.79 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  59.09 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  59.52 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  51.72 
 
 		 384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  45.45 
 
 		 388 aa  308  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.99 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  38.33 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  37.9 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  34.56 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  38.96 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  36.65 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  36.39 
 
 		 402 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  37.14 
 
 		 403 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  35.64 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  35.81 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  34.68 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  36.73 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  36.73 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  36.73 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.16 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  35.19 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  35.16 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  35.5 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.34 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  36.39 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.62 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  31.82 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 388 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.32 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.3 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.89 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.81 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33.97 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  33.5 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.13 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.4 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  31.44 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  32.81 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.13 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.59 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  34.07 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.89 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.62 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.32 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.35 
 
 		 395 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.42 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.43 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  32.63 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.2 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.2 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.34 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.32 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.9 
 
 		 383 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.52 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  29.84 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.83 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  31.63 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  29.95 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  34.1 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.09 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  31.63 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  31.63 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 		 394 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.75 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  31.34 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30.89 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  31.11 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  32.9 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  30.35 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.82 
 
 		 392 aa  146  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.92 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.63 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  32.56 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.67 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.67 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.67 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.34 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.97 
 
 		 384 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  32.99 
 
 		 391 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.67 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.75 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.42 
 
 		 387 aa  142  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.81 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  31.37 
 
 		 388 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.4 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.4 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.18 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  29.13 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.27 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.75 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>