More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3292 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
164 aa  340  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3943  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  97.56 
 
 
164 aa  332  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  83.02 
 
 
158 aa  277  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2851  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  84.08 
 
 
187 aa  276  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.944597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.75 
 
 
157 aa  269  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2582  iron-sulfur cluster-binding protein; potential subunit of aldehyde oxidoreductase  78.98 
 
 
158 aa  265  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  65.85 
 
 
159 aa  221  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0501046  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1298  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.9 
 
 
178 aa  202  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1704  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.23 
 
 
159 aa  137  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0911  iron-sulfur cluster-binding protein  44.29 
 
 
159 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.91 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000221809  normal  0.228333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.88 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000011696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.14 
 
 
157 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.87 
 
 
157 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  41.14 
 
 
157 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  39.87 
 
 
157 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  41.14 
 
 
157 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.49 
 
 
153 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0382  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.31 
 
 
162 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.248119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.24 
 
 
157 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  39.87 
 
 
157 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.87 
 
 
157 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  39.87 
 
 
157 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1832  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  37.25 
 
 
158 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.87 
 
 
157 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.66 
 
 
671 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  40.51 
 
 
157 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.716266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.1 
 
 
667 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  39.24 
 
 
157 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0189  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.22 
 
 
180 aa  98.6  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.84 
 
 
173 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.5 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.17 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.76 
 
 
551 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.72 
 
 
658 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.33 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.93 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.76 
 
 
641 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02070  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  35.33 
 
 
252 aa  94  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  40.76 
 
 
639 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  40.76 
 
 
639 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.58 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.76 
 
 
639 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  35.58 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.76 
 
 
639 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
594 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.76 
 
 
639 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  35.58 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  35.58 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.58 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  35.58 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.8 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.08 
 
 
674 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.43 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.85 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  34.13 
 
 
181 aa  91.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.56 
 
 
659 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.71 
 
 
674 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1792  electron transport protein HydN  32.96 
 
 
189 aa  90.5  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.288357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.53 
 
 
214 aa  90.5  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2349  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.62 
 
 
184 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.53 
 
 
214 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2008  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.14 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3097  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.53 
 
 
214 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.56 
 
 
659 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.53 
 
 
214 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.13 
 
 
644 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  31.98 
 
 
659 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  31.98 
 
 
659 aa  89  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.98 
 
 
659 aa  89  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.98 
 
 
659 aa  89  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.98 
 
 
659 aa  89  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  31.98 
 
 
659 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.85 
 
 
671 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.85 
 
 
671 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
181 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000340892  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
181 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1426  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.59 
 
 
190 aa  87.8  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.87 
 
 
176 aa  87.8  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20870  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  35.57 
 
 
204 aa  87.4  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  35.8 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1834  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.67 
 
 
168 aa  87.4  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0770  molybdopterin-containing oxidoreductase iron-sulfur subunit  34.64 
 
 
185 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.978327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0665  molybdopterin-containing oxidoreductase iron-sulfur subunit  34.64 
 
 
185 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.801479  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0724  molybdopterin-containing oxidoreductase iron-sulfur subunit  34.64 
 
 
185 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>