220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3260 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  100 
 
 		 488 aa  963    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  80.53 
 
 		 498 aa  789    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  99.8 
 
 		 488 aa  961    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  77.46 
 
 		 488 aa  753    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  52.75 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  55.63 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  47.44 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  50.42 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  48.26 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  47.2 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  45.87 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  43.36 
 
 		 482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  42.77 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  45.77 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  44.61 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  46.06 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  43.15 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  42.27 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  41.86 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  41.86 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  42.71 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  40.91 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  41.03 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  43.42 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  41.36 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  43.6 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  42.95 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  41.82 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  41.65 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  41.65 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  40.37 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  41.65 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  44.83 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  41.14 
 
 		 485 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  41.14 
 
 		 485 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  41.14 
 
 		 485 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  41.14 
 
 		 485 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  40.88 
 
 		 486 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  42.86 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  41.65 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  43.09 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  42.44 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  42.44 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  42.44 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  42.44 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  42.44 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  42.44 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  40.72 
 
 		 485 aa  359  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  42.03 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  42.03 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  42.03 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  42.03 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  42.03 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  42.03 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  42.03 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  44.21 
 
 		 485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  42.03 
 
 		 483 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  43.06 
 
 		 483 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  42.03 
 
 		 483 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  42.36 
 
 		 483 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  41.91 
 
 		 483 aa  353  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  41.02 
 
 		 488 aa  349  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  43.67 
 
 		 485 aa  348  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  42.54 
 
 		 483 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  42.98 
 
 		 483 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  42.98 
 
 		 483 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  42.77 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  37.35 
 
 		 487 aa  324  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  41.7 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  39.26 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  36.51 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.31 
 
 		 478 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  41.24 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.24 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  38.57 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  38.57 
 
 		 491 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  36.48 
 
 		 485 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  37.12 
 
 		 484 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  36.82 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  39.19 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  37.22 
 
 		 479 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  36.81 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  38.81 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  36.4 
 
 		 481 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  35.39 
 
 		 486 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  37.04 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  39.29 
 
 		 490 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  37.92 
 
 		 484 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.08 
 
 		 483 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  37.71 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  39.22 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  38.6 
 
 		 498 aa  293  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.44 
 
 		 480 aa  292  8e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  36.46 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  41.27 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  38.43 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  37.92 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  37.47 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  37.08 
 
 		 484 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.5 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>