More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3128 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  98.28 
 
 
348 aa  691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
348 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  78.62 
 
 
390 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
293 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  36.72 
 
 
338 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  36.31 
 
 
300 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.21 
 
 
554 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  34.19 
 
 
263 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  37.71 
 
 
292 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  36.63 
 
 
826 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  36.51 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  36.81 
 
 
517 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  33.14 
 
 
287 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  35.94 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.55 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.82 
 
 
433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.14 
 
 
586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.21 
 
 
751 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  40.14 
 
 
319 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
308 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  33.23 
 
 
517 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  31.59 
 
 
293 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.33 
 
 
742 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  28.76 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  30.87 
 
 
952 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.56 
 
 
398 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  33.11 
 
 
301 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.4 
 
 
398 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.59 
 
 
829 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  32.9 
 
 
668 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  32.25 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.08 
 
 
475 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  32.13 
 
 
286 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  32.08 
 
 
551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  35.43 
 
 
600 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  35.64 
 
 
549 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.62 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.55 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  32.67 
 
 
587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.52 
 
 
301 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  35.48 
 
 
556 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  31.15 
 
 
267 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  30.53 
 
 
303 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  36.12 
 
 
628 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  29.71 
 
 
1911 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.14 
 
 
1581 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  31.35 
 
 
246 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  34.71 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  29.24 
 
 
654 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  29.79 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.12 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  30.79 
 
 
283 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  33.08 
 
 
605 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  31.42 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  31.5 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  28.88 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  27.94 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.66 
 
 
768 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  27.44 
 
 
346 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  31.74 
 
 
384 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 
538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  33.14 
 
 
375 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  30.03 
 
 
922 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  30.59 
 
 
416 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  30.55 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  32.42 
 
 
624 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  32.91 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  30.72 
 
 
877 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 
1043 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.06 
 
 
614 aa  114  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  28 
 
 
288 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
367 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2927  hypothetical protein  28.24 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3178  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  28.85 
 
 
584 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  30.7 
 
 
269 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.2 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  35.86 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  34.92 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  27.92 
 
 
288 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  31.68 
 
 
304 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  29.7 
 
 
664 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
509 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  32.47 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 
740 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  30.62 
 
 
336 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  33.13 
 
 
304 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  32.04 
 
 
384 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  30.34 
 
 
1160 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 
324 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  31.01 
 
 
611 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  33.69 
 
 
349 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  30.29 
 
 
527 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  30.81 
 
 
408 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
616 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>