84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3124 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
223 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
223 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  80.36 
 
 
224 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  74.01 
 
 
227 aa  344  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  74.55 
 
 
224 aa  335  3e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  64.13 
 
 
222 aa  292  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  62.95 
 
 
224 aa  291  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  61.88 
 
 
222 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  52.94 
 
 
271 aa  274  1e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
224 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
236 aa  174  1e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.72 
 
 
224 aa  172  3e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
224 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
224 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
224 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 
236 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  42.98 
 
 
225 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  42.13 
 
 
224 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  42.13 
 
 
224 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  39.55 
 
 
224 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  37 
 
 
225 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 
224 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.28 
 
 
224 aa  131  1e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  34.67 
 
 
236 aa  127  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
236 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
244 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.87 
 
 
222 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
230 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
229 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
232 aa  120  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  117  2e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
236 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
236 aa  115  7e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
288 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
236 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
236 aa  110  2e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
234 aa  108  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 
223 aa  108  8e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  32.31 
 
 
236 aa  108  8e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
236 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  35.22 
 
 
229 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  35.22 
 
 
229 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  35.45 
 
 
229 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  35.22 
 
 
229 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  35.22 
 
 
229 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  35.22 
 
 
229 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  35.22 
 
 
229 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  35.22 
 
 
229 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
234 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
235 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  30.09 
 
 
238 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  34.86 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  26.78 
 
 
250 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 
211 aa  84.3  1e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
218 aa  77  2e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
237 aa  57.8  1e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.67 
 
 
166 aa  49.3  4e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
209 aa  49.3  4e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  24.2 
 
 
232 aa  48.9  6e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
157 aa  48.9  6e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
214 aa  48.1  9e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
168 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  35.14 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.08 
 
 
444 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.56 
 
 
155 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  33.78 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  36.49 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.88 
 
 
442 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  36.71 
 
 
168 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.71 
 
 
168 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  35.14 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.4 
 
 
442 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  39.44 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.04 
 
 
174 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  23.89 
 
 
223 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3906  Phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 
170 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.98 
 
 
174 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.95 
 
 
168 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  25.55 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  24.68 
 
 
601 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>