245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3113 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 468 aa  901    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  99.57 
 
 		 486 aa  896    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  70.25 
 
 		 461 aa  587  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  58.67 
 
 		 455 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  58.22 
 
 		 455 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  59.91 
 
 		 453 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  57.65 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  60.18 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  50.77 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  48.12 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  48.87 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  44.3 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  40.53 
 
 		 452 aa  319  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.98 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  39.82 
 
 		 470 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  37.36 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  37.36 
 
 		 450 aa  300  5e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  41.11 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  39.56 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37 
 
 		 449 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  41.19 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  43.71 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  40.17 
 
 		 464 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  39.34 
 
 		 476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  41.41 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  41.38 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  39.23 
 
 		 457 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  38.59 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  39.45 
 
 		 464 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  37.56 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  40.14 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  40.22 
 
 		 486 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  37.56 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  37.56 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  37.56 
 
 		 446 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  37.56 
 
 		 446 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  40.22 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  37.81 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  37.1 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.88 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  41.41 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.43 
 
 		 446 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.88 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  41.2 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.65 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  40.69 
 
 		 443 aa  267  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.54 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  36.34 
 
 		 461 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  39.37 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  34.26 
 
 		 469 aa  263  6e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  38.61 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  37.85 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  39.57 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.75 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  39.06 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  38.34 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  35.98 
 
 		 450 aa  250  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.68 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.71 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  36.91 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  36.71 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.71 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  36.94 
 
 		 445 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  36.94 
 
 		 445 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.71 
 
 		 445 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.94 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.71 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.54 
 
 		 449 aa  246  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 		 445 aa  246  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  37.47 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.07 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  31.5 
 
 		 454 aa  242  9e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.57 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  29.35 
 
 		 454 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.15 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  39.8 
 
 		 446 aa  240  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  36.77 
 
 		 447 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  35.79 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  31.9 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.44 
 
 		 447 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  36.63 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  35.38 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  35.92 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  36.75 
 
 		 467 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.63 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  32.29 
 
 		 446 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  32.29 
 
 		 446 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  37.96 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  33.55 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0404  sodium:neurotransmitter symporter  35.46 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.630301  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  33.86 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>