90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3112 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  96.85 
 
 		 403 aa  786    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  100 
 
 		 413 aa  818    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  72.93 
 
 		 409 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  57.97 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  54.7 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  30.51 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  29.66 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  33.16 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  32.64 
 
 		 439 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  29.44 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  28.22 
 
 		 429 aa  90.1  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  32.62 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  29.08 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  30 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  32.72 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  25.25 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  27.04 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.98 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  22.42 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  27.84 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  27.45 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  25.93 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  27.08 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  26.23 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  25.51 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  29.89 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  23.22 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  22.61 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  24.42 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  22.7 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  21.29 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  24.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  28.19 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.99 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  23.62 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  25.97 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  23.04 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  26.15 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  21.74 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  24.22 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  26.75 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  24.14 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  28.37 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  26.71 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  27.84 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  33.55 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  24.7 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  28.98 
 
 		 463 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  30.61 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  28.04 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  28.4 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  25.54 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  29.94 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  22.97 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  22.93 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  24.06 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  23.58 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  25.32 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  21.57 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  28.5 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  26.45 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  27.88 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  21.48 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  22.83 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  27.03 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  25.71 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  26 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0972  signal transduction protein  25.78 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  24.53 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  22.76 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  23.51 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  23.4 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  27.11 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  26.06 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  25 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>