More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3087 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  100 
 
 
493 aa  949    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  71.77 
 
 
490 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  70.1 
 
 
501 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  68.77 
 
 
506 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  59.92 
 
 
494 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  57.63 
 
 
492 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  55.92 
 
 
492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  49.01 
 
 
497 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  49.61 
 
 
492 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  49.03 
 
 
472 aa  342  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  48.24 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  46.18 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  45.06 
 
 
462 aa  328  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  44.68 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  45.13 
 
 
492 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  43.06 
 
 
467 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  43.25 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  41.63 
 
 
498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  44.42 
 
 
481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  44.02 
 
 
482 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  43.03 
 
 
483 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  43 
 
 
469 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  40.08 
 
 
493 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  40.08 
 
 
493 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  41.21 
 
 
484 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  41.38 
 
 
437 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  42.66 
 
 
488 aa  292  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  41.01 
 
 
485 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  40.54 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  52.02 
 
 
609 aa  253  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  38.11 
 
 
506 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  36.81 
 
 
505 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  37.18 
 
 
505 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  38.11 
 
 
506 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  38.15 
 
 
506 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  38.25 
 
 
502 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  38.9 
 
 
493 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  57.2 
 
 
388 aa  231  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  67.65 
 
 
475 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  67.06 
 
 
475 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  44.86 
 
 
517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  71.97 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  44.05 
 
 
516 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  71.34 
 
 
404 aa  220  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  54.29 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  52.51 
 
 
392 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  35.71 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  68.79 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  63.53 
 
 
431 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.19 
 
 
276 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  58.73 
 
 
393 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  39.9 
 
 
687 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  58.2 
 
 
394 aa  200  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  65.61 
 
 
387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  57.23 
 
 
402 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  66.23 
 
 
375 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  57.56 
 
 
280 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  59.28 
 
 
279 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  65.82 
 
 
294 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  58.24 
 
 
580 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  56.02 
 
 
375 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  63.69 
 
 
272 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  60.59 
 
 
272 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  32 
 
 
391 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  53.97 
 
 
376 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  35.25 
 
 
516 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  55.05 
 
 
412 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  61.84 
 
 
279 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  62.42 
 
 
294 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  56.36 
 
 
378 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  61.15 
 
 
272 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  55.42 
 
 
376 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  56.02 
 
 
379 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  61.18 
 
 
286 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  34.83 
 
 
481 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  61.84 
 
 
287 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  56.8 
 
 
379 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  54.84 
 
 
282 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  47.77 
 
 
390 aa  183  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  47.77 
 
 
390 aa  183  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  55.38 
 
 
373 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  56.02 
 
 
377 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  56.63 
 
 
377 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  54.55 
 
 
384 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  56.63 
 
 
377 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  55.26 
 
 
398 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  55.42 
 
 
377 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  54.55 
 
 
384 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  61.35 
 
 
278 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  55.42 
 
 
377 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  54.82 
 
 
377 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  54.82 
 
 
377 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  54.82 
 
 
377 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  60.14 
 
 
278 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  55.42 
 
 
378 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  51.93 
 
 
377 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  56.4 
 
 
380 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  58.6 
 
 
272 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  58.6 
 
 
272 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  57.96 
 
 
271 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>