138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2905 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  99.5 
 
 
617 aa  1234    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  67.69 
 
 
583 aa  814    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  100 
 
 
606 aa  1241    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  52.9 
 
 
589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  52.89 
 
 
588 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  52.36 
 
 
588 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  52.36 
 
 
588 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  51.86 
 
 
585 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  52.85 
 
 
588 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  52.49 
 
 
588 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  52.85 
 
 
588 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  50.6 
 
 
590 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  52.49 
 
 
588 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  50.86 
 
 
589 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  53.74 
 
 
588 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  52.44 
 
 
576 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  49.74 
 
 
589 aa  557  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  52.29 
 
 
587 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  53.39 
 
 
587 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  54.73 
 
 
596 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  52.08 
 
 
589 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  46.76 
 
 
557 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  46.21 
 
 
557 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  46.34 
 
 
600 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  45.82 
 
 
564 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  46.19 
 
 
582 aa  449  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  44.69 
 
 
574 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  38.22 
 
 
566 aa  362  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  38.76 
 
 
587 aa  357  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  37.04 
 
 
622 aa  356  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  37.34 
 
 
674 aa  356  6.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  40.41 
 
 
555 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  38.42 
 
 
540 aa  350  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  41.57 
 
 
550 aa  349  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  40 
 
 
540 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  38.11 
 
 
541 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  39.09 
 
 
523 aa  329  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  36.82 
 
 
541 aa  326  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  33.68 
 
 
530 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  34.38 
 
 
641 aa  263  6.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  33.22 
 
 
530 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  32.76 
 
 
531 aa  249  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  33.02 
 
 
522 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  33.76 
 
 
555 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  34.29 
 
 
511 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  35.2 
 
 
516 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  33.85 
 
 
529 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  33.98 
 
 
530 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  32.71 
 
 
534 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  31.83 
 
 
523 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  32.81 
 
 
538 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  31.76 
 
 
523 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
535 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  32.76 
 
 
528 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  34.39 
 
 
502 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.82 
 
 
540 aa  238  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  33.27 
 
 
549 aa  237  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  34.13 
 
 
545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  32.4 
 
 
538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  33.94 
 
 
523 aa  234  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  34.58 
 
 
523 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  32.92 
 
 
519 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  31.99 
 
 
531 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  32.65 
 
 
529 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  31.51 
 
 
529 aa  231  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  32.31 
 
 
522 aa  229  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  33.27 
 
 
563 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  31.76 
 
 
538 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.79 
 
 
524 aa  227  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.46 
 
 
552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  34.44 
 
 
554 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  30.13 
 
 
679 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  30.86 
 
 
523 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  32.73 
 
 
618 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  32.35 
 
 
558 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  30.63 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  29.91 
 
 
791 aa  213  7.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  31.18 
 
 
521 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  33.6 
 
 
520 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 
521 aa  207  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  33.08 
 
 
532 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  31.37 
 
 
528 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  30.13 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  34.1 
 
 
534 aa  200  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  31.68 
 
 
513 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  29.91 
 
 
529 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 
670 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  33.89 
 
 
534 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  30.84 
 
 
494 aa  193  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  32.04 
 
 
544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  31.67 
 
 
525 aa  183  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.08 
 
 
524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  33.91 
 
 
529 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  29.13 
 
 
575 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  27.6 
 
 
450 aa  152  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.21 
 
 
714 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
710 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  32.68 
 
 
744 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.83 
 
 
689 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  29.17 
 
 
523 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>