More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2870 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  98.87 
 
 
266 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  78.26 
 
 
265 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  55.95 
 
 
263 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  54.65 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  53.57 
 
 
263 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  53.57 
 
 
263 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  53.57 
 
 
263 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  50.2 
 
 
261 aa  263  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  53.31 
 
 
263 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  51.16 
 
 
263 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 
259 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  51.75 
 
 
263 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  50.19 
 
 
263 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  54.09 
 
 
263 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  48.46 
 
 
396 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  48.46 
 
 
392 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  45.16 
 
 
373 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  46.85 
 
 
262 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  45.42 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  46.36 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  46.72 
 
 
263 aa  221  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  45.24 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  50.81 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  46.3 
 
 
263 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  43.97 
 
 
260 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  45.28 
 
 
265 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  44.75 
 
 
263 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  44.79 
 
 
265 aa  215  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  42.69 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  40.86 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  44.09 
 
 
269 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  45.91 
 
 
261 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  45.91 
 
 
261 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  47.52 
 
 
261 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  42.02 
 
 
260 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  43.53 
 
 
261 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  43.95 
 
 
260 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  45.91 
 
 
261 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  45.53 
 
 
261 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  45.53 
 
 
261 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  45.53 
 
 
261 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  43.65 
 
 
258 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  44.05 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  44.23 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  44.23 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  44.23 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  44.23 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.23 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  44.23 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.46 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  42.41 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  43.82 
 
 
256 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  43.93 
 
 
270 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  42.74 
 
 
270 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  43.43 
 
 
256 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  43.43 
 
 
256 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  42.86 
 
 
270 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  44.72 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  42.23 
 
 
256 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  40 
 
 
260 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  40 
 
 
260 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  44.31 
 
 
393 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  39.3 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  42.64 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  42.51 
 
 
251 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  41.76 
 
 
262 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  38.62 
 
 
260 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  38.25 
 
 
263 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  43.27 
 
 
256 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  41.09 
 
 
393 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  39 
 
 
282 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  36.86 
 
 
377 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  42.86 
 
 
397 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  41.5 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  36.02 
 
 
265 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 
262 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  41.13 
 
 
393 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 
279 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 
279 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  36.29 
 
 
279 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  38.13 
 
 
264 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 
262 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  39.42 
 
 
264 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  36.22 
 
 
282 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 
396 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 
254 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  39.42 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  35.46 
 
 
263 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  41.25 
 
 
391 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  36.95 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
255 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  37.07 
 
 
268 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  38.02 
 
 
267 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  36.13 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  37.3 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  39.45 
 
 
390 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  37.92 
 
 
425 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>