157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2812 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  98.68 
 
 
228 aa  447  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  77.55 
 
 
237 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  68.37 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  65.22 
 
 
209 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  53.65 
 
 
209 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  53.4 
 
 
212 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  52.76 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  52.02 
 
 
208 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  52.02 
 
 
208 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  44.65 
 
 
217 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  46.57 
 
 
257 aa  187  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  48.22 
 
 
204 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  46.08 
 
 
217 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  48.44 
 
 
222 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  48.44 
 
 
222 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  48.69 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  40.87 
 
 
235 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  50.76 
 
 
211 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  42.05 
 
 
206 aa  174  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  42.5 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  44.33 
 
 
202 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  50.52 
 
 
211 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  41 
 
 
204 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  42.93 
 
 
215 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  50.52 
 
 
211 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  46.35 
 
 
210 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  42.57 
 
 
201 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  45.03 
 
 
200 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  45.03 
 
 
200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  44.04 
 
 
203 aa  161  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  43.72 
 
 
204 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  44.27 
 
 
210 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  45.81 
 
 
215 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  45.73 
 
 
214 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  41.88 
 
 
233 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  37.98 
 
 
238 aa  151  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  43.2 
 
 
211 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  43.23 
 
 
202 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  41.15 
 
 
234 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  43.23 
 
 
202 aa  144  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.31 
 
 
215 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  37.2 
 
 
215 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  42.27 
 
 
203 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  38.86 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  39.11 
 
 
239 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  36.08 
 
 
204 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  37.56 
 
 
202 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  37.63 
 
 
237 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  36.79 
 
 
205 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  37.11 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  37.11 
 
 
212 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  36.75 
 
 
217 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  34.72 
 
 
198 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  38.8 
 
 
200 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  39.15 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  38.25 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  44.76 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  27.27 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  27.72 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  30.4 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  22.68 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.7 
 
 
279 aa  63.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  31.71 
 
 
309 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  26.39 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.86 
 
 
292 aa  61.6  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  28.82 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  29.93 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  23.78 
 
 
295 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  28.67 
 
 
302 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  29.93 
 
 
288 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  23.49 
 
 
296 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  30.4 
 
 
290 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  30.4 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  30.34 
 
 
288 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  27.98 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  26.92 
 
 
290 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  27.01 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  24.03 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  27.01 
 
 
285 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  22.67 
 
 
322 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  26.01 
 
 
297 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  23.64 
 
 
282 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.69 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  27.48 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  29.8 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  26.14 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0209  protein of unknown function DUF161  34.01 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.951556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  26.95 
 
 
283 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  24.28 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  24.28 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  24.28 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  24.28 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  24.28 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  24.28 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  24.28 
 
 
297 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  24.85 
 
 
295 aa  52  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  30.61 
 
 
288 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  30 
 
 
304 aa  51.6  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>