47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2759 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  75.66 
 
 		 226 aa  358  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  68.58 
 
 		 223 aa  318  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  68.58 
 
 		 223 aa  317  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  67.7 
 
 		 223 aa  316  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  68.14 
 
 		 223 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  71.57 
 
 		 224 aa  310  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  67.26 
 
 		 223 aa  308  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  69.63 
 
 		 228 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  70.05 
 
 		 225 aa  305  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  68.72 
 
 		 223 aa  301  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  68.72 
 
 		 223 aa  301  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  71.5 
 
 		 228 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  67.44 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  68.6 
 
 		 227 aa  294  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  63.06 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  64.02 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  66.2 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  62.16 
 
 		 222 aa  278  5e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  66.19 
 
 		 225 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  66.19 
 
 		 225 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  64.73 
 
 		 225 aa  277  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  64.59 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  64.59 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  64.59 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  65.71 
 
 		 225 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  65.02 
 
 		 207 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  61.06 
 
 		 225 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  64.53 
 
 		 207 aa  274  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  61.06 
 
 		 225 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  64.73 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  64.73 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  59.35 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  93.94 
 
 		 100 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  33.94 
 
 		 323 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  32.89 
 
 		 324 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  38.22 
 
 		 321 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  42.37 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  41.62 
 
 		 320 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  32.47 
 
 		 337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  34.07 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  28.65 
 
 		 321 aa  88.6  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  26.15 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  30.69 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  24.26 
 
 		 332 aa  48.9  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  28.87 
 
 		 574 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  25.85 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>