More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2686 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
650 aa  1309    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  40.46 
 
 
653 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  40.71 
 
 
635 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.25 
 
 
659 aa  300  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.21 
 
 
663 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.21 
 
 
663 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 
663 aa  298  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.21 
 
 
663 aa  298  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.21 
 
 
663 aa  298  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.06 
 
 
663 aa  297  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.57 
 
 
656 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.72 
 
 
641 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  32.37 
 
 
640 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
648 aa  290  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.36 
 
 
650 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.21 
 
 
650 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.21 
 
 
650 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.21 
 
 
650 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.21 
 
 
650 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 
657 aa  281  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
649 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 
649 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 
662 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 
680 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 
662 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 
661 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 
653 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 
662 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 
681 aa  267  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 
649 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
726 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  31.03 
 
 
653 aa  253  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 
665 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  31.31 
 
 
652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.88 
 
 
655 aa  234  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 
698 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
426 aa  229  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 
652 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
713 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 
740 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.16 
 
 
656 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  30.75 
 
 
700 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.17 
 
 
666 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  29.17 
 
 
666 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  29.17 
 
 
666 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  27.91 
 
 
665 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
658 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  27.91 
 
 
665 aa  216  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  27.91 
 
 
665 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  29.31 
 
 
666 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  29.36 
 
 
746 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  27.97 
 
 
666 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  27.88 
 
 
665 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.74 
 
 
744 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
799 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  30.31 
 
 
676 aa  215  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  29.01 
 
 
744 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 
799 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.23 
 
 
663 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.39 
 
 
663 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 
634 aa  211  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  28.87 
 
 
744 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  28.82 
 
 
633 aa  211  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 
799 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
715 aa  206  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.44 
 
 
696 aa  203  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
698 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
698 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
698 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 
713 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.29 
 
 
696 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  28.31 
 
 
698 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.53 
 
 
695 aa  197  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  28.23 
 
 
696 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 
702 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 
743 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  28.15 
 
 
732 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  27.31 
 
 
742 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  28.18 
 
 
702 aa  192  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
664 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  28.85 
 
 
639 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  26.87 
 
 
742 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 
714 aa  185  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  26.41 
 
 
696 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  27.44 
 
 
746 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  27.5 
 
 
746 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  27.57 
 
 
746 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  27.57 
 
 
746 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  27.57 
 
 
746 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  27.08 
 
 
746 aa  181  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  27.5 
 
 
746 aa  181  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  27.57 
 
 
746 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 
746 aa  180  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  28.4 
 
 
746 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.41 
 
 
746 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.39 
 
 
751 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.39 
 
 
751 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
697 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  27.89 
 
 
704 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>