More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2607 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  100 
 
 
308 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  100 
 
 
308 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  91.56 
 
 
308 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  74.03 
 
 
308 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  74.35 
 
 
308 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  74.03 
 
 
308 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  74.03 
 
 
308 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  73.7 
 
 
308 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  73.38 
 
 
308 aa  459  1e-128  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  73.38 
 
 
319 aa  459  1e-128  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  73.7 
 
 
308 aa  460  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  73.7 
 
 
319 aa  460  1e-128  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  74.03 
 
 
308 aa  460  1e-128  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  73.38 
 
 
319 aa  459  1e-128  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  75.32 
 
 
308 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  75.32 
 
 
308 aa  453  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  73.7 
 
 
308 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  58.84 
 
 
308 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  58.52 
 
 
308 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  58.77 
 
 
308 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  58.84 
 
 
308 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.93 
 
 
308 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.88 
 
 
308 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.88 
 
 
308 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.88 
 
 
308 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3754  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.47 
 
 
308 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3832  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.47 
 
 
308 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3934  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.47 
 
 
308 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3875  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.47 
 
 
308 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03306  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03259  hypothetical protein  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3936  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3655  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0259  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3865  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3739  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.23 
 
 
308 aa  345  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3765  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.47 
 
 
308 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4774  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0258  inner-membrane translocator  57.23 
 
 
308 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3860  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  57.14 
 
 
308 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  59.68 
 
 
307 aa  342  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  59.08 
 
 
303 aa  338  1e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1157  inner-membrane translocator  58.96 
 
 
307 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197851  normal  0.0247648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1174  inner-membrane translocator  58.96 
 
 
307 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1140  inner-membrane translocator  58.96 
 
 
307 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4277  inner-membrane translocator  58.63 
 
 
307 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9657  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  56.82 
 
 
307 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  58.88 
 
 
304 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  58.55 
 
 
304 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3846  inner-membrane translocator  58.39 
 
 
307 aa  326  4e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221591  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4109  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.69 
 
 
307 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.180327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5396  inner-membrane translocator  59.41 
 
 
304 aa  320  1e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  54.82 
 
 
304 aa  320  2e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  54.67 
 
 
307 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4304  branched-chain amino acid transport protein BraD  57.33 
 
 
307 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  56.44 
 
 
302 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  55.05 
 
 
302 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50530  branched-chain amino acid transport protein BraD  56.25 
 
 
307 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  53.95 
 
 
304 aa  311  7e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1386  inner-membrane translocator  57.96 
 
 
307 aa  311  8e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.738637  normal  0.190253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  55.34 
 
 
309 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  55.92 
 
 
338 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  53.64 
 
 
304 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19640  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, permease component  57.88 
 
 
307 aa  309  3e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105896  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0568  inner-membrane translocator  55.33 
 
 
304 aa  308  7e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  54.61 
 
 
304 aa  307  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  1.55208e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  54.93 
 
 
304 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  1.77319e-11 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  54.61 
 
 
304 aa  307  1e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  53.64 
 
 
304 aa  305  4e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  53.47 
 
 
305 aa  305  4e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  54.61 
 
 
304 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  54.64 
 
 
304 aa  305  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  52.96 
 
 
304 aa  302  4e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26120  ABC-transporter permease protein  54.61 
 
 
304 aa  301  8e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000346731  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  52.27 
 
 
302 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  52.98 
 
 
304 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  54.15 
 
 
305 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  53.87 
 
 
302 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  54.15 
 
 
305 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2249  inner-membrane translocator  53.64 
 
 
305 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.749308 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.33 
 
 
302 aa  293  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.33 
 
 
302 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5437  inner-membrane translocator  53.27 
 
 
306 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4330  inner-membrane translocator  55.15 
 
 
305 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.06779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  51 
 
 
302 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3900  inner-membrane translocator  50.99 
 
 
305 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5637  branched chain amino acid ABC transporter permease  52.96 
 
 
304 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  49.34 
 
 
300 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  49.01 
 
 
300 aa  284  1e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1747  inner-membrane translocator  52.29 
 
 
306 aa  284  2e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2081  inner-membrane translocator  50.99 
 
 
305 aa  282  6e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0611  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.19 
 
 
302 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  48.01 
 
 
300 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  50 
 
 
293 aa  274  1e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.83 
 
 
291 aa  272  5e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  46.36 
 
 
300 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
290 aa  262  5e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  43.65 
 
 
300 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
293 aa  258  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  2.63386e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.87 
 
 
301 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>