More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2547 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  976  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  84.1 
 
 
478 aa  744  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  73.85 
 
 
498 aa  703  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3601  aldehyde dehydrogenase  72.35 
 
 
481 aa  655  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  68.91 
 
 
474 aa  663  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  99.17 
 
 
496 aa  969  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  51.47 
 
 
473 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  51.97 
 
 
473 aa  458  1e-128  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
480 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
480 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
480 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
480 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
477 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
480 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
480 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  47.82 
 
 
477 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  48.32 
 
 
480 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
472 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 
475 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
477 aa  415  1e-115  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  47.96 
 
 
476 aa  418  1e-115  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
481 aa  417  1e-115  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
474 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  48.61 
 
 
472 aa  416  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
472 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  45.68 
 
 
472 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
472 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  45.02 
 
 
473 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 
476 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
476 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  47.75 
 
 
480 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
467 aa  407  1e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.41 
 
 
479 aa  408  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  45.4 
 
 
472 aa  405  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
490 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
474 aa  401  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  48.39 
 
 
476 aa  401  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
472 aa  400  1e-110  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
511 aa  401  1e-110  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  42.64 
 
 
474 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  47.67 
 
 
477 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
478 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
475 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  44.59 
 
 
476 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 
476 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  47.88 
 
 
460 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  42 
 
 
474 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
474 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
510 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
474 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
474 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  42.22 
 
 
474 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
476 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
474 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
474 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
474 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3791  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
477 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
485 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
479 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
473 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
479 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
487 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  44.15 
 
 
483 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
473 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  43.99 
 
 
491 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0661  aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
465 aa  375  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
491 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  45.12 
 
 
490 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  43.99 
 
 
491 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
476 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  42.73 
 
 
471 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
484 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  46.93 
 
 
469 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  40.43 
 
 
475 aa  363  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 
479 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  44.99 
 
 
466 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  43.78 
 
 
479 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.52 
 
 
475 aa  360  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  43.7 
 
 
462 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
475 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  44.54 
 
 
470 aa  358  1e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
470 aa  358  1e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  39.22 
 
 
460 aa  357  2e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
465 aa  355  8e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
484 aa  355  8e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
484 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  43.26 
 
 
469 aa  352  7e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  43.8 
 
 
477 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  45.36 
 
 
475 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
470 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  44.27 
 
 
480 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  40.43 
 
 
462 aa  345  9e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  41.96 
 
 
465 aa  343  3e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0742  aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
468 aa  343  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>