More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2356 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  98.48 
 
 		 329 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  663    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  79.82 
 
 		 328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  81 
 
 		 326 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  70.61 
 
 		 420 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  63.93 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  60.24 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  51.17 
 
 		 323 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  49.15 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4039  hypothetical protein  48.81 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.64 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.64 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  45.15 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.4 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  45.96 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  45.79 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  43.83 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.08 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.43 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  44.24 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.94 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.42 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.8 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.48 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.49 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.72 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.57 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  43.97 
 
 		 335 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.49 
 
 		 341 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  42.41 
 
 		 698 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.37 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.65 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  46.84 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.49 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.73 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.31 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.27 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  45.21 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  43.62 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.28 
 
 		 333 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 328 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.24 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.36 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.77 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.77 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  42.63 
 
 		 343 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.77 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.97 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.96 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.35 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.62 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.35 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  44.3 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.79 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.85 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.1 
 
 		 322 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  41.57 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  41 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.25 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.76 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.62 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  44.03 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.18 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  40.31 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.79 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.73 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.62 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.37 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.09 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.58 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  43.79 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  45.21 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  43.79 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.62 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  42.22 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  43.29 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.73 
 
 		 356 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.11 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.05 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.2 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  42.48 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.28 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.64 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.33 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.33 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.51 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  43.2 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.14 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.23 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  40.62 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.69 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.22 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  40.2 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>