More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2314 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 466 aa  915    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  99.14 
 
 		 466 aa  906    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  68.33 
 
 		 442 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  65.18 
 
 		 446 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  55.31 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  54.72 
 
 		 430 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  49.34 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.99 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  46.54 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  44.98 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  46.34 
 
 		 471 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  41.71 
 
 		 432 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.71 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.42 
 
 		 430 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.52 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  38.31 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  44.42 
 
 		 418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  44.42 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  45.02 
 
 		 418 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.95 
 
 		 404 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.47 
 
 		 419 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.96 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  34.63 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  39.33 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.79 
 
 		 395 aa  220  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.27 
 
 		 430 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 		 419 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  37.6 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  32.89 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 407 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.65 
 
 		 424 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  37.47 
 
 		 429 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.05 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.35 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.37 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  39.58 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  38.11 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  30.62 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  35.54 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  31.86 
 
 		 415 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  31 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  31.31 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  30.95 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 		 416 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  33.03 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 416 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 416 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  30.77 
 
 		 372 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  32.26 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  32.26 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  29.63 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  29.63 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.26 
 
 		 371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  30.77 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  30.77 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  30.77 
 
 		 372 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  30.77 
 
 		 372 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  28.71 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  29.32 
 
 		 370 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  31.94 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  31.94 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  31.94 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  31.94 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  31.94 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  31.94 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  31.13 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  29.14 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.56 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  30.98 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  31.08 
 
 		 569 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  31.83 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  28.05 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 		 505 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.67 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  28.95 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  31.35 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  26.29 
 
 		 509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.46 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  32.75 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  29.94 
 
 		 383 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  29.69 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>