283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2237 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  96.03 
 
 
151 aa  299  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.1 
 
 
163 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  56.62 
 
 
162 aa  163  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.41 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.72 
 
 
163 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.03 
 
 
163 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  57.04 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  50.68 
 
 
157 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
157 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.49 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.67 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  52.74 
 
 
158 aa  150  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.86 
 
 
152 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.62 
 
 
155 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  61.61 
 
 
159 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.49 
 
 
146 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.71 
 
 
145 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  60.71 
 
 
159 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  60.71 
 
 
159 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  52.71 
 
 
149 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.82 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.95 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.65 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  55.37 
 
 
158 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.16 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  58.04 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.86 
 
 
154 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.63 
 
 
145 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  50.39 
 
 
145 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.17 
 
 
159 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  55.75 
 
 
159 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.98 
 
 
159 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  53.06 
 
 
159 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  50.39 
 
 
145 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.78 
 
 
146 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  52.11 
 
 
154 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  46.62 
 
 
153 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  49.31 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.31 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  48.61 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.87 
 
 
145 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  54.03 
 
 
155 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.37 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  47.92 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.1 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.87 
 
 
145 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
150 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
150 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
150 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
150 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.92 
 
 
145 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  47.92 
 
 
145 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.43 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  55.17 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
150 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
283 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  51.97 
 
 
143 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.18 
 
 
159 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 
150 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 
153 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
145 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.76 
 
 
159 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
145 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  50.75 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.75 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  48.32 
 
 
157 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.83 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  45.64 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  45.64 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  55.83 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  56.67 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.09 
 
 
152 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.16 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  48.09 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  48.09 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.48 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  55.26 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  55 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  50.39 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  48.06 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  55.26 
 
 
167 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  56.14 
 
 
163 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 
150 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.8 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  54.39 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.7 
 
 
152 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  48.85 
 
 
146 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.2 
 
 
163 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.14 
 
 
155 aa  123  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
167 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.05 
 
 
152 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  45.93 
 
 
144 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  51.54 
 
 
152 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
150 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  53.91 
 
 
158 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>