62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2197 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 164 aa  340  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  87.8 
 
 		 163 aa  296  9e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  94.3 
 
 		 166 aa  286  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  71.43 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  55.33 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  57.55 
 
 		 272 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  55.03 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  55.03 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  63.33 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  46.91 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  46.5 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  45.68 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  45.1 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  56.3 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  47.24 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  45.18 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  46.71 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  45.58 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  47.06 
 
 		 171 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  45.03 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  54.62 
 
 		 181 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  47.89 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  51.26 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  42.17 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  45.39 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  49.24 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  47.48 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  45.1 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  50 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  51.16 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  44.72 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  38.51 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  38.67 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  42.11 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  42.75 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  39.86 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  34.39 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  35.11 
 
 		 205 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  38.71 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  36.24 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  38.84 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  41.67 
 
 		 190 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  32.09 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  44.44 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  34.42 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  40.44 
 
 		 189 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  37.1 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  34.93 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  34.67 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  36.15 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  34 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  32.64 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  25.84 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  27.35 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  28.08 
 
 		 534 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  26.92 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  25 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  26.27 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  23.42 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  25.69 
 
 		 157 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  25.47 
 
 		 505 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>