47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2171 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  59.94 
 
 
329 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  78.29 
 
 
187 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  55.71 
 
 
83 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  28.75 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  27.39 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  23.6 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  26.19 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  27.22 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  24.48 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  28.33 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  27.47 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  29.49 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  28.41 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  23.77 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  27.01 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  26.34 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  37.14 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  24.5 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  26.45 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  51.79 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  24.79 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  30.29 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  27.71 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  30.29 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  25.79 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  39.25 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  27.7 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  39.25 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  28.17 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  44.62 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  28.04 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  27.62 
 
 
355 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  27 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  37.08 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  25.43 
 
 
315 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  27.5 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  24.86 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  26.75 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  36.89 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  25.69 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  42.42 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  36.51 
 
 
399 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  39.71 
 
 
246 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>