More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2133 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  84.07 
 
 
561 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  74.38 
 
 
562 aa  787    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  85.31 
 
 
561 aa  929    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  85.49 
 
 
561 aa  931    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  75.75 
 
 
560 aa  816    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  76.51 
 
 
562 aa  815    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  82.12 
 
 
561 aa  880    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  85.31 
 
 
561 aa  929    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  83.36 
 
 
561 aa  909    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  100 
 
 
564 aa  1140    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  84.96 
 
 
561 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  85.31 
 
 
561 aa  929    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  85.31 
 
 
561 aa  929    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  78.33 
 
 
562 aa  827    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  78.15 
 
 
547 aa  847    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  77.98 
 
 
547 aa  845    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  71.34 
 
 
467 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  91.15 
 
 
565 aa  1001    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  85.31 
 
 
561 aa  929    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  70.91 
 
 
503 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  84.78 
 
 
561 aa  923    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  99.82 
 
 
564 aa  1138    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  57.5 
 
 
551 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  68.31 
 
 
468 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  54.24 
 
 
550 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  67.09 
 
 
468 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  59.25 
 
 
541 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  62.18 
 
 
479 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  55.42 
 
 
552 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  57.69 
 
 
479 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.56 
 
 
473 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  48.04 
 
 
767 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  48.35 
 
 
767 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  40.53 
 
 
546 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  40.04 
 
 
546 aa  385  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  39.86 
 
 
546 aa  382  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  47.52 
 
 
745 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  46.92 
 
 
475 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  42.78 
 
 
550 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  46.82 
 
 
479 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  42.4 
 
 
548 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  42.38 
 
 
546 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  44.02 
 
 
457 aa  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  45.91 
 
 
481 aa  331  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  45.34 
 
 
478 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  44.3 
 
 
476 aa  321  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.55 
 
 
557 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  41.56 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  41.56 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  41.56 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  42.68 
 
 
467 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  40.13 
 
 
480 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  43.09 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  41.65 
 
 
482 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  43.1 
 
 
474 aa  302  9e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  43.1 
 
 
474 aa  302  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  40 
 
 
468 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.63 
 
 
468 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.36 
 
 
469 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  37.71 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.39 
 
 
468 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  40.45 
 
 
458 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  36.6 
 
 
453 aa  276  8e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.36 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  36.34 
 
 
464 aa  273  7e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  39.83 
 
 
477 aa  273  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  35.14 
 
 
484 aa  262  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  38.03 
 
 
448 aa  258  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  34.27 
 
 
449 aa  251  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  37.72 
 
 
484 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 
482 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.22 
 
 
482 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.86 
 
 
475 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.16 
 
 
462 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  58.9 
 
 
228 aa  232  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.56 
 
 
471 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.98 
 
 
482 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.03 
 
 
485 aa  230  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 
470 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  36.52 
 
 
470 aa  227  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
484 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.79 
 
 
484 aa  224  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.43 
 
 
459 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  32.91 
 
 
510 aa  224  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.16 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  32.03 
 
 
504 aa  223  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  32.7 
 
 
516 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.6 
 
 
470 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.42 
 
 
460 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  34.38 
 
 
507 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
492 aa  220  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.11 
 
 
466 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  34.66 
 
 
507 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  34.6 
 
 
455 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  33.65 
 
 
453 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.23 
 
 
459 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
470 aa  216  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1392  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.78 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.6 
 
 
439 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  34.17 
 
 
722 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>