More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2116 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  100 
 
 		 594 aa  1213    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  52.79 
 
 		 572 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  52.41 
 
 		 589 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  49.76 
 
 		 634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  53.13 
 
 		 563 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  52.63 
 
 		 569 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  66.75 
 
 		 639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  48.84 
 
 		 638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  54.64 
 
 		 568 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  64.2 
 
 		 474 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  51.35 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  62.53 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  54.15 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  56.04 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  51.02 
 
 		 624 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  61.05 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  49.24 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  52.65 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  49.41 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  57.71 
 
 		 677 aa  422  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  51.18 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  52.15 
 
 		 487 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  51.54 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  49.6 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  51.79 
 
 		 742 aa  413  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  56.87 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  47.83 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  59.89 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 478 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  52.48 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  59.89 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  53.09 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  59.4 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  47.62 
 
 		 560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  47.19 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  48.23 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  53.35 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  54.74 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  52.98 
 
 		 470 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  47.98 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  54.2 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  47.21 
 
 		 608 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  48.06 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  48.69 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  53.57 
 
 		 452 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  51.81 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  47.96 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  51.23 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  49.88 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  47.74 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  46.76 
 
 		 455 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  47.74 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  47.74 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  45.83 
 
 		 473 aa  389  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  53.78 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  51.67 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.17 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.17 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  47.36 
 
 		 454 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  46.22 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  47.36 
 
 		 454 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.22 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  47.36 
 
 		 454 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  50.37 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  53.42 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  53.57 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  49.88 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  53.5 
 
 		 450 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  46.67 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  52.31 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  45.71 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  50.41 
 
 		 467 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  43.22 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  57.32 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  49.09 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  49.09 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  49.35 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  46.72 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  53.02 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  49.09 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  45.33 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  49.09 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  56.76 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  49.56 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  49.09 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  49.09 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  47.25 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  45.25 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  54.28 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  45.68 
 
 		 465 aa  369  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  47.25 
 
 		 433 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  45.27 
 
 		 482 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  47 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  45.52 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  44.6 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  45.54 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>