More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2072 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  634    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  634    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  91.22 
 
 
319 aa  537  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  79.31 
 
 
319 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  82.76 
 
 
319 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  79.94 
 
 
319 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  85.58 
 
 
319 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  84.01 
 
 
319 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  84.64 
 
 
319 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  61.03 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  58.76 
 
 
322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  52.63 
 
 
314 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  50.94 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  47.32 
 
 
314 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  50.67 
 
 
308 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  48.58 
 
 
314 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  49.83 
 
 
324 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  47.95 
 
 
314 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  47.56 
 
 
314 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  49.83 
 
 
328 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  50.36 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  48.44 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  48.44 
 
 
314 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  47.4 
 
 
313 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  45.97 
 
 
315 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  42.24 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  44.33 
 
 
325 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  42.46 
 
 
358 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  39.08 
 
 
337 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  40.68 
 
 
328 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  38.48 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  40.73 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  38.49 
 
 
329 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  43.45 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  39.86 
 
 
345 aa  228  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  40.29 
 
 
323 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  41.23 
 
 
317 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  38.83 
 
 
328 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  38.14 
 
 
339 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  36.64 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  39.44 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  36.3 
 
 
334 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  35.91 
 
 
336 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  35.05 
 
 
374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  35.99 
 
 
338 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  34.93 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  35.74 
 
 
335 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  34.59 
 
 
328 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  34.59 
 
 
328 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  34.83 
 
 
333 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  35.91 
 
 
331 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  33.56 
 
 
329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  35.29 
 
 
330 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  35.25 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  33.11 
 
 
346 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  34.18 
 
 
321 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  30.82 
 
 
323 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  31.74 
 
 
326 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  30.79 
 
 
325 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  30.62 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  30.79 
 
 
323 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  33.22 
 
 
326 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  33.77 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  31.15 
 
 
326 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  30.74 
 
 
324 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.72 
 
 
322 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  33.45 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  30.72 
 
 
334 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.03 
 
 
322 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.03 
 
 
322 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  28.89 
 
 
317 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  29.08 
 
 
317 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  29.08 
 
 
317 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  29.08 
 
 
317 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.51 
 
 
342 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  33.46 
 
 
336 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  33.04 
 
 
320 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  29.09 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  28.89 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  28.89 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  29.54 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  31.31 
 
 
325 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  29.38 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  30.1 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  29.97 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  31.05 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  30.61 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  28.92 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  30.1 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  30.2 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  29.47 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  29.87 
 
 
326 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  28.71 
 
 
333 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  30.1 
 
 
326 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  30.45 
 
 
327 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  29.81 
 
 
323 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  31.08 
 
 
318 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  29.53 
 
 
326 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  29.53 
 
 
326 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>