More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2049 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  98.53 
 
 		 273 aa  550  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  74.72 
 
 		 269 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  74.17 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  73.78 
 
 		 269 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  69.63 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  68.71 
 
 		 279 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  63.7 
 
 		 270 aa  342  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  60.37 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  50.9 
 
 		 274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  50.73 
 
 		 274 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  48.91 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  49.27 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  48.72 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  43.45 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 		 260 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  40.3 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  43.9 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.49 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.55 
 
 		 571 aa  66.2  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.57 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.57 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  31.88 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.88 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  40.65 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  33.08 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 288 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  32.33 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  22.87 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.69 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.77 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.49 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.89 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  31.35 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  21.79 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  21.79 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  28.08 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  21.79 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.4 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  22.14 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  30.83 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  30.83 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>