90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1802 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  100 
 
 
320 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  79.94 
 
 
320 aa  507  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  72.19 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  72.19 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  73.16 
 
 
335 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  70.81 
 
 
323 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  69.69 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  69.69 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  69.69 
 
 
320 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  64.74 
 
 
324 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  61.54 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  55.13 
 
 
325 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  54.29 
 
 
332 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  54.49 
 
 
325 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  55.45 
 
 
331 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  55.45 
 
 
325 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  55.45 
 
 
325 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  55.45 
 
 
325 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  56.16 
 
 
303 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  56.16 
 
 
303 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  55.94 
 
 
273 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  55.94 
 
 
273 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  47.4 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  47.25 
 
 
312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  46.93 
 
 
323 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  44.81 
 
 
313 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  43.69 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  43.83 
 
 
313 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  44.7 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.69 
 
 
328 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  32.92 
 
 
333 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.11 
 
 
363 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  37.89 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  34.85 
 
 
141 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5227  chromate resistance signal  83.33 
 
 
53 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266795  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  39.01 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  39.01 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  31.34 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  31.34 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  32.33 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  30.6 
 
 
157 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  37.59 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  30.18 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  32.59 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  37.24 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  30.6 
 
 
152 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  36.3 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.11 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  30.37 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  31.85 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  30.6 
 
 
182 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  26.88 
 
 
192 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  36.88 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  32.59 
 
 
150 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  28.36 
 
 
140 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  33.88 
 
 
128 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  31.41 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  31.58 
 
 
143 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  27.82 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  30.6 
 
 
139 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  25.66 
 
 
196 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  31.34 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  31.34 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  31.34 
 
 
142 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  31.34 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  30.52 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  31.34 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  31.34 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  31.34 
 
 
142 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  34 
 
 
181 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  25.16 
 
 
183 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  26.81 
 
 
172 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  26.54 
 
 
187 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  35.05 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  26.12 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  31.16 
 
 
171 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  29.47 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3855  ChrB domain-containing protein  26.42 
 
 
181 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  28.92 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5569  hypothetical protein  25.9 
 
 
181 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>