196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1749 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  100 
 
 
295 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  99.66 
 
 
295 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  93.17 
 
 
293 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  87.03 
 
 
294 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  83.28 
 
 
296 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  77.47 
 
 
298 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  77.47 
 
 
298 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  83.62 
 
 
296 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  77.47 
 
 
298 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  76.79 
 
 
298 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  76.45 
 
 
298 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  76.45 
 
 
298 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  76.45 
 
 
298 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  76.45 
 
 
336 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  77.13 
 
 
339 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  75.77 
 
 
298 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  76.45 
 
 
298 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  76.45 
 
 
298 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  76.45 
 
 
298 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  76.45 
 
 
298 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  76.45 
 
 
298 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  73.72 
 
 
302 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  73.72 
 
 
302 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  77.82 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  73.1 
 
 
303 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  71.23 
 
 
313 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  60.14 
 
 
299 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  60.14 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  61.17 
 
 
312 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  59.4 
 
 
299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  57.48 
 
 
300 aa  315  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  54.95 
 
 
299 aa  315  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  58.19 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  55.86 
 
 
294 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  55.52 
 
 
294 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  55.48 
 
 
292 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  58.54 
 
 
292 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  55.52 
 
 
294 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  53.58 
 
 
295 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  52.26 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  51.86 
 
 
317 aa  279  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  51.53 
 
 
311 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  49.66 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  50.51 
 
 
327 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  51.37 
 
 
329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  50.54 
 
 
306 aa  258  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  47.02 
 
 
325 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  51.53 
 
 
330 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  47.93 
 
 
297 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  50.52 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  49.14 
 
 
304 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  45.87 
 
 
313 aa  239  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  48.32 
 
 
330 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  48.08 
 
 
307 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  45.92 
 
 
309 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
293 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  47.65 
 
 
640 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 
298 aa  205  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 
305 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.01 
 
 
299 aa  203  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 
305 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  41.05 
 
 
306 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
299 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.35 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.35 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  45.33 
 
 
299 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  41.2 
 
 
303 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  39.49 
 
 
289 aa  192  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.81 
 
 
365 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 
287 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.48 
 
 
289 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
363 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  39.38 
 
 
299 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  34.89 
 
 
329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.15 
 
 
584 aa  158  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
300 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  61.22 
 
 
120 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  23.38 
 
 
338 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  24.24 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  30.45 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  29.49 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  23.86 
 
 
341 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.08 
 
 
348 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  27.04 
 
 
405 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  27.04 
 
 
405 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  27.04 
 
 
405 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  29.06 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  28 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  26.18 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  27.78 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  28.95 
 
 
365 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  27.99 
 
 
345 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  24.91 
 
 
341 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  28.8 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  28.09 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  29.09 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  27.78 
 
 
339 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  26.07 
 
 
345 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>