More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1721 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 313 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  99.36 
 
 		 313 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  93.61 
 
 		 313 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  87.54 
 
 		 313 aa  580  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  88.82 
 
 		 326 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  82.43 
 
 		 313 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  79.62 
 
 		 314 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  79.94 
 
 		 314 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  83.6 
 
 		 317 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  75.71 
 
 		 317 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  75.81 
 
 		 321 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  58.47 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 		 313 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  58.1 
 
 		 313 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  56.19 
 
 		 313 aa  361  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  54.95 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  54.63 
 
 		 313 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  55.59 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  52.16 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  51.83 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  51.83 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  51.83 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  51.83 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  51.83 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  51.83 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  51.83 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  51.31 
 
 		 311 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  51.63 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  50.96 
 
 		 313 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  51.16 
 
 		 308 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  51.16 
 
 		 308 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  50.17 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  50.5 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  50.17 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  50.5 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  50.17 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  49.35 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  50.17 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  49.83 
 
 		 308 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  49.03 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 312 aa  301  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  48.05 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  48.21 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  45.69 
 
 		 324 aa  298  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  45.37 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  45.28 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  48.34 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  45.37 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  46.35 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  45.28 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  43.97 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  45.37 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  44.73 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  48.03 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  44.73 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  49.34 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  44.73 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  44.41 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  47.04 
 
 		 326 aa  292  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 354 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  46.05 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  48.03 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  49.34 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  44.27 
 
 		 335 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  46.38 
 
 		 306 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  44.41 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  46.08 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  43.87 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  43.23 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1200  transcriptional regulator CysB  44.08 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  41.94 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  42.11 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0301  transcriptional regulator CysB  42.58 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  44.84 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01793  transcriptional regulator CysB  41.75 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  44.84 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  41.94 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  42.11 
 
 		 324 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>