More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1687 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  99.58 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  88.98 
 
 		 236 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  89.41 
 
 		 236 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  88.56 
 
 		 236 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  88.56 
 
 		 236 aa  417  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  88.56 
 
 		 236 aa  417  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  88.56 
 
 		 236 aa  417  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  81.97 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  81.82 
 
 		 245 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  81.47 
 
 		 234 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  79.83 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  81.97 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  84.26 
 
 		 235 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  85.22 
 
 		 244 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  79.4 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  79.65 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  80.52 
 
 		 236 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  77.68 
 
 		 243 aa  368  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  78.45 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  78.17 
 
 		 234 aa  361  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  75.43 
 
 		 241 aa  358  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  49.32 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  47.95 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  90.08 
 
 		 122 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  49.09 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  48.28 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  52.78 
 
 		 235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 229 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.04 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.47 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.58 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.58 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  47.71 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.91 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 		 221 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  38.94 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  41.63 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  38.53 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.81 
 
 		 642 aa  166  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  40.71 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4467  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.04 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  41.28 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  41.74 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.86 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.91 
 
 		 642 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.37 
 
 		 640 aa  165  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  41.59 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  41.52 
 
 		 654 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  44.19 
 
 		 687 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  42.86 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.38 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 643 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  38.57 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  38.57 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  41.18 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.05 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.71 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.71 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  43.26 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  38.99 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  42.48 
 
 		 655 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  42.27 
 
 		 681 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  42.27 
 
 		 681 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.09 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  45.66 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.09 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  41.82 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  39.21 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  43.06 
 
 		 668 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  38.99 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.73 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1685  ABC transporter related  42.72 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000384234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  44.2 
 
 		 658 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  40.83 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.97 
 
 		 644 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  40.71 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>