164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1485 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  99.39 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  57.93 
 
 		 161 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  49.08 
 
 		 160 aa  153  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  48.78 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  40.85 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  46.83 
 
 		 187 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  46.83 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  41.84 
 
 		 201 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  44 
 
 		 220 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  46.34 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  43.85 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  43.17 
 
 		 301 aa  101  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  40.7 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.8 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  38.65 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  45.04 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  44.35 
 
 		 134 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  42.42 
 
 		 191 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.41 
 
 		 261 aa  95.5  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  34.5 
 
 		 272 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 		 558 aa  94.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  44.86 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  43.9 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  45.53 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  43.9 
 
 		 178 aa  91.3  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 193 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  41.98 
 
 		 596 aa  91.3  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  44.95 
 
 		 190 aa  91.3  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  47.17 
 
 		 168 aa  90.5  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  39.29 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  36.94 
 
 		 202 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  41.61 
 
 		 186 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  40.88 
 
 		 202 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  44.25 
 
 		 279 aa  88.2  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  34.65 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 194 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 194 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  37.88 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  38.65 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  41.46 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 		 184 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 194 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.53 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  40.52 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  38.85 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 		 133 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  38.93 
 
 		 238 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  39.23 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  38.92 
 
 		 315 aa  85.5  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  42.62 
 
 		 231 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 192 aa  85.1  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  40.15 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.2 
 
 		 133 aa  84.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 133 aa  84.3  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  35.71 
 
 		 186 aa  84  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  43.55 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  35.2 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  38.84 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  38.84 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  40.35 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  40.35 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  39.07 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  40.35 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  38.6 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  39.07 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  38.69 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  34.83 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  40 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  43.56 
 
 		 194 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  42.31 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  37.72 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  39.17 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  34.96 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  34.44 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  34.96 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  38.05 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  34.96 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  40.38 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  40.78 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  37.72 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  39.17 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  37.72 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  40.78 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  39.81 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  33.07 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.9 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  33.15 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.7 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>