20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1463 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  100 
 
 
435 aa  828  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  38.89 
 
 
414 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  37.02 
 
 
415 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  30.09 
 
 
409 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  35.87 
 
 
420 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  32.55 
 
 
419 aa  135  2e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  35.66 
 
 
418 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  35.66 
 
 
418 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  38.04 
 
 
456 aa  129  8e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  35.37 
 
 
418 aa  129  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  35.95 
 
 
411 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  30.63 
 
 
443 aa  52  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 
455 aa  52  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  36.03 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  32.7 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  26.6 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  28.03 
 
 
397 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  36.08 
 
 
426 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.91 
 
 
455 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>