More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1421 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1421  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2677  LysR family transcriptional regulator  72.38 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2996  LysR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 274 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.563844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2552  LysR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2407  MarR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3254  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819694  normal  0.147179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5011  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.967403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5138  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5191  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0327  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5370  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.626785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1835  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5518  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593502  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3528  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2210  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0660  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3460  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143807  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2218  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.573789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3369  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3681  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4082  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3146  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47310  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2533  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4604  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4470  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0844089  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3758  putative transcriptional regulator  35.13 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3168  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.655223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2547  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291089  decreased coverage  0.00703073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3682  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.903074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7527  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44180  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3166  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3260  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.670628  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1279  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3084  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115544  normal  0.0198492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3199  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6501  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711222  normal  0.162689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2144  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0485  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1695  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.909005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4611  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.144049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4477  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861356  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4191  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.58 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4288  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.423442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2143  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2115  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29540  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  29.59 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  23.86 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1783  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000134706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  29.69 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0606  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.85701  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0127  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2282  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4699  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.21 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3384  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0678  HTH-type transciptional regulator, LysR-family  28.77 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0849029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1537  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000701673  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>