148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1359 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  98.08 
 
 		 205 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  53.24 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  45.04 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  44.44 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  41.5 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  45.38 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  41.98 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  40.77 
 
 		 238 aa  101  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  41.3 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  33.93 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  34.29 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  39.47 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  38.16 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.03 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  36.6 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35.25 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.16 
 
 		 171 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  34.33 
 
 		 184 aa  88.2  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  37.4 
 
 		 169 aa  87.8  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  39.42 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.06 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.67 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  38 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.34 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  35.81 
 
 		 153 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.64 
 
 		 150 aa  85.1  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.33 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.65 
 
 		 148 aa  84.7  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.6 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  31.34 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  27.81 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.6 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.87 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.04 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.14 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  37.91 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  35.82 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.85 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  32.43 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.67 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.97 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  32.67 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  36.3 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  32.89 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.52 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  38.13 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.61 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.87 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.91 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  34.69 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  37.5 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  36.09 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  31.47 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  36.69 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  39.32 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.61 
 
 		 158 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  33.54 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  26.71 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  33.82 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  31.03 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  31.11 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  28.46 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.89 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.52 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.87 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  35.94 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.48 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  25.74 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.64 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  27.69 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.23 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.71 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.71 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  27.69 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  28 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  32.37 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.51 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.69 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  31.39 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  29.59 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  27.48 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  31.5 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.76 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  29.85 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  27.56 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.22 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.07 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.76 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  29.71 
 
 		 388 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>