156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1212 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  78.68 
 
 
212 aa  315  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  59.09 
 
 
204 aa  235  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  62.18 
 
 
209 aa  233  1e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  62.18 
 
 
211 aa  233  2e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  56.92 
 
 
204 aa  231  4e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  53.47 
 
 
204 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  53.47 
 
 
204 aa  221  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  55.5 
 
 
222 aa  220  1e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  55.5 
 
 
222 aa  220  1e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  55.15 
 
 
210 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  55.15 
 
 
210 aa  213  1e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  52.58 
 
 
235 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  49.77 
 
 
215 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  53.03 
 
 
209 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  48.73 
 
 
206 aa  203  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  54.08 
 
 
215 aa  199  2e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  46.86 
 
 
257 aa  200  2e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  46.38 
 
 
217 aa  197  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  52.02 
 
 
228 aa  197  1e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  52.02 
 
 
228 aa  196  2e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  49.76 
 
 
204 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  54.64 
 
 
211 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  53.47 
 
 
211 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  44.91 
 
 
217 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  54.64 
 
 
211 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  51.55 
 
 
202 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  50.52 
 
 
211 aa  191  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  48.97 
 
 
200 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  54.97 
 
 
237 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  48.97 
 
 
200 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  52.36 
 
 
202 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  47.21 
 
 
202 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  47.12 
 
 
233 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  49.22 
 
 
203 aa  184  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  46.91 
 
 
238 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  51.04 
 
 
237 aa  181  5e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  48.76 
 
 
214 aa  178  5e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  46.39 
 
 
202 aa  172  3e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  47.4 
 
 
201 aa  171  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  46 
 
 
208 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3211e-07 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  45.36 
 
 
203 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  45.88 
 
 
200 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  45.88 
 
 
234 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  44.67 
 
 
205 aa  154  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.40279e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  51.83 
 
 
233 aa  152  3e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  43.65 
 
 
198 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  44.33 
 
 
237 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  45.4 
 
 
239 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  43.46 
 
 
202 aa  132  4e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  40.61 
 
 
212 aa  131  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  37.7 
 
 
204 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  38.22 
 
 
215 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  36.87 
 
 
215 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  60 
 
 
109 aa  117  8e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  35.15 
 
 
217 aa  114  2e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  40.84 
 
 
200 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  42.29 
 
 
229 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  33.13 
 
 
292 aa  77.8  1e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  26.34 
 
 
294 aa  72.8  3e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  34.81 
 
 
281 aa  71.6  9e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  29.37 
 
 
295 aa  70.5  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.25851e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  33.77 
 
 
314 aa  68.9  5e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  28.67 
 
 
288 aa  68.2  8e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  33.13 
 
 
296 aa  66.2  4e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  28.48 
 
 
283 aa  65.9  4e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  25.64 
 
 
283 aa  64.3  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.01824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.29 
 
 
311 aa  64.7  1e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  30.22 
 
 
296 aa  63.2  3e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  27.5 
 
 
191 aa  62.4  4e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  30.56 
 
 
288 aa  62.4  5e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  28.74 
 
 
322 aa  62.4  5e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.56 
 
 
279 aa  60.8  1e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  28.48 
 
 
290 aa  60.1  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.85246e-09  unclonable  1.21594e-10 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  28.89 
 
 
288 aa  60.1  2e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  26.32 
 
 
299 aa  60.1  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  27.56 
 
 
287 aa  60.1  3e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  31.79 
 
 
313 aa  58.5  6e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  27.56 
 
 
285 aa  58.2  8e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  3.75547e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  29.89 
 
 
288 aa  58.2  8e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  28.26 
 
 
298 aa  58.2  9e-08  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  24.23 
 
 
290 aa  58.2  1e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  27.56 
 
 
285 aa  57.4  1e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  24.31 
 
 
290 aa  57  2e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.41108e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  29.85 
 
 
287 aa  57  2e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  31.65 
 
 
311 aa  57.4  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  7.76906e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  30.07 
 
 
302 aa  57.4  2e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  7.86758e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  24.28 
 
 
283 aa  55.8  4e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  32.3 
 
 
304 aa  55.1  8e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  26.11 
 
 
287 aa  55.1  8e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  29.41 
 
 
278 aa  54.3  1e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2185  hypothetical protein  28.74 
 
 
286 aa  52.8  4e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  28.29 
 
 
293 aa  52.8  4e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  29.68 
 
 
283 aa  51.6  9e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  30.12 
 
 
287 aa  50.8  1e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2836  protein of unknown function DUF161  30.66 
 
 
281 aa  51.2  1e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  29.49 
 
 
290 aa  50.8  1e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  25.9 
 
 
287 aa  50.1  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.55591e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  30.34 
 
 
281 aa  49.7  4e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>