111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1198 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  60.83 
 
 
615 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  67.4 
 
 
618 aa  799    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  56.27 
 
 
599 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  99.34 
 
 
606 aa  1218    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  67.26 
 
 
506 aa  684    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
606 aa  1226    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.98 
 
 
585 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
541 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.45 
 
 
631 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.49 
 
 
663 aa  92.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.99 
 
 
609 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  23.08 
 
 
627 aa  91.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.71 
 
 
658 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.66 
 
 
683 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.45 
 
 
683 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.45 
 
 
683 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.31 
 
 
612 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.71 
 
 
665 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.45 
 
 
684 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.5 
 
 
659 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.81 
 
 
613 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.36 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.19 
 
 
627 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  24.34 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  32.58 
 
 
351 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  20.4 
 
 
615 aa  72  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.48 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.38 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.73 
 
 
581 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.73 
 
 
581 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.12 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  34.07 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  23.78 
 
 
634 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  35.04 
 
 
490 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  19.6 
 
 
484 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.56 
 
 
840 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
361 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  37.37 
 
 
392 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.78 
 
 
845 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  28.19 
 
 
429 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  20.67 
 
 
576 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.08 
 
 
580 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.61 
 
 
422 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.17 
 
 
634 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.84 
 
 
848 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  19.88 
 
 
610 aa  60.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  20.3 
 
 
570 aa  61.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.45 
 
 
393 aa  60.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  23.37 
 
 
885 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.39 
 
 
852 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  31 
 
 
384 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.71 
 
 
526 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  37.39 
 
 
293 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  20.33 
 
 
575 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.59 
 
 
850 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  35.85 
 
 
293 aa  54.3  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36 
 
 
406 aa  53.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.36 
 
 
862 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  29.06 
 
 
452 aa  51.6  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.55 
 
 
580 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.98 
 
 
400 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.89 
 
 
355 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  39.73 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  39.73 
 
 
342 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  39.73 
 
 
342 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  39.73 
 
 
342 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  19.83 
 
 
577 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  22.54 
 
 
858 aa  50.8  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  38.36 
 
 
342 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  30 
 
 
242 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  26.72 
 
 
388 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  34.25 
 
 
1247 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  30 
 
 
242 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  38.36 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  38.36 
 
 
341 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.68 
 
 
848 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  29.23 
 
 
262 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  30 
 
 
242 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  29.23 
 
 
242 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  30 
 
 
242 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  30 
 
 
242 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  29.23 
 
 
262 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.23 
 
 
262 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  38.36 
 
 
346 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  29.23 
 
 
262 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  29.23 
 
 
242 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  29.23 
 
 
262 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  29.46 
 
 
821 aa  48.5  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.05 
 
 
559 aa  48.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  34.88 
 
 
343 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  28.26 
 
 
355 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.59 
 
 
874 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  34.72 
 
 
365 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  29.63 
 
 
241 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  29.27 
 
 
256 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  29.27 
 
 
256 aa  47.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  38.36 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  37.5 
 
 
242 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  28.46 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>