More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1158 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  100 
 
 
484 aa  977    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  51.63 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  47.64 
 
 
482 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  48.28 
 
 
476 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  47.55 
 
 
480 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  46.75 
 
 
478 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  46.22 
 
 
477 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  46.33 
 
 
476 aa  379  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  46.33 
 
 
476 aa  379  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  46.33 
 
 
476 aa  379  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  43.67 
 
 
546 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  45.96 
 
 
474 aa  355  6.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  45.75 
 
 
467 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  45.74 
 
 
474 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  44.08 
 
 
546 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  39.48 
 
 
546 aa  335  9e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  39.48 
 
 
546 aa  335  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  42.83 
 
 
548 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  41.18 
 
 
550 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  40.69 
 
 
457 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  41.79 
 
 
458 aa  300  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  38.83 
 
 
767 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  38.78 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  39.1 
 
 
745 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  36.11 
 
 
475 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  38.56 
 
 
503 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  36.5 
 
 
469 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  38.7 
 
 
767 aa  280  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  37.42 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  37.82 
 
 
468 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  37.26 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  36.58 
 
 
469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  39.47 
 
 
468 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  37.8 
 
 
557 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  35.14 
 
 
468 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  35.09 
 
 
551 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.88 
 
 
471 aa  256  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  37.67 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  38.44 
 
 
547 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  38.9 
 
 
561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  38.9 
 
 
561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  38.23 
 
 
547 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  38.9 
 
 
561 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  35.28 
 
 
550 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.15 
 
 
484 aa  253  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  37.9 
 
 
541 aa  253  7e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  38.9 
 
 
561 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  38.9 
 
 
561 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  38.9 
 
 
561 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  38.44 
 
 
561 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  38.44 
 
 
561 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  32.55 
 
 
484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  38.91 
 
 
562 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.11 
 
 
712 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.79 
 
 
463 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  33.89 
 
 
479 aa  242  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  37.61 
 
 
561 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
468 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  32.06 
 
 
485 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  34.88 
 
 
453 aa  240  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.63 
 
 
467 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
469 aa  239  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
466 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
482 aa  239  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  35.47 
 
 
464 aa  239  9e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 
470 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.75 
 
 
462 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.79 
 
 
471 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  37.72 
 
 
564 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
468 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  36.03 
 
 
476 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
467 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  38.74 
 
 
560 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  37.72 
 
 
564 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  34.49 
 
 
552 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  38.2 
 
 
565 aa  237  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.3 
 
 
459 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  33.55 
 
 
448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.19 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
466 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
449 aa  236  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.81 
 
 
482 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.54 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  36.5 
 
 
561 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
468 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
467 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
466 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  32.62 
 
 
468 aa  233  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  32.68 
 
 
479 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 
459 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
467 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  33.06 
 
 
515 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
467 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.07 
 
 
495 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  33.47 
 
 
500 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  33.54 
 
 
511 aa  230  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>