More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1047 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  99.57 
 
 		 265 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  71.37 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  62.27 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  56 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  53.18 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  50.91 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  42.06 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  42.06 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  38.28 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  36.82 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 284 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 255 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  32.55 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 262 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  23.35 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  29.9 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>