81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1009 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  98.74 
 
 
239 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  53.72 
 
 
238 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  58.82 
 
 
197 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  48.62 
 
 
261 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  44.3 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  42.8 
 
 
225 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1209  hypothetical protein  46.92 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2825  hypothetical protein  43.53 
 
 
230 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00604868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  31.03 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  31.03 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  31.03 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2469  putative transmembrane protein  39.04 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  30.85 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  32.14 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  32.42 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  32.98 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  35.89 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  30.62 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  30.62 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  30.58 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  30.58 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2770  putative transmembrane protein  34.45 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  30 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  32.2 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  32.47 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  32.83 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  31.44 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  30.85 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  30.85 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  31.68 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  30.96 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  30.53 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  30.73 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  31.02 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  31.28 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  34.24 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  27.62 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  32.3 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  30.27 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  32.04 
 
 
231 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  28.72 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.56 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  29.08 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  32.63 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  30.1 
 
 
279 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  32.09 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  31.02 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  30.69 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  29 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  33.15 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  31.05 
 
 
288 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  28.45 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  28.07 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  29.91 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  30.09 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  30.3 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  36.11 
 
 
186 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2033  transmembrane protein  30.7 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  27.16 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  25.29 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  25.82 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  35.96 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  32.82 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  32.82 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  26.74 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  27.68 
 
 
409 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  20.6 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  57.5 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  29.05 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  35.09 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  30.46 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  31.63 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  27.17 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  30.37 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  21.47 
 
 
221 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  23.33 
 
 
621 aa  41.6  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>