More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0880 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  95.29 
 
 
169 aa  314  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  89.09 
 
 
181 aa  308  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  97.48 
 
 
170 aa  303  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  85.88 
 
 
165 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  88.75 
 
 
165 aa  300  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  86.88 
 
 
162 aa  293  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  86.88 
 
 
162 aa  293  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  86.25 
 
 
162 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  85.71 
 
 
163 aa  290  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  85.71 
 
 
163 aa  290  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  85.71 
 
 
163 aa  290  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  83.53 
 
 
165 aa  289  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  87.73 
 
 
165 aa  282  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  81.44 
 
 
177 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  87.58 
 
 
163 aa  280  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  87.5 
 
 
162 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  87.5 
 
 
162 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  87.5 
 
 
162 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  87.5 
 
 
162 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  87.5 
 
 
162 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  87.5 
 
 
162 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  88.2 
 
 
163 aa  280  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  86.88 
 
 
162 aa  279  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  86.25 
 
 
162 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  83.02 
 
 
162 aa  276  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  88.3 
 
 
171 aa  275  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  91.76 
 
 
169 aa  274  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 
162 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  86.88 
 
 
162 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  86.88 
 
 
162 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  86.88 
 
 
162 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  86.25 
 
 
162 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  86.25 
 
 
162 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  86.25 
 
 
162 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  83.65 
 
 
163 aa  267  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  77.85 
 
 
161 aa  265  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  79.25 
 
 
162 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  76.25 
 
 
162 aa  259  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  79.63 
 
 
163 aa  258  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  74.38 
 
 
163 aa  257  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  74.21 
 
 
163 aa  256  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  74.07 
 
 
163 aa  256  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  74.07 
 
 
163 aa  256  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.88 
 
 
162 aa  245  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  69.18 
 
 
163 aa  237  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  73.75 
 
 
162 aa  235  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  67.7 
 
 
163 aa  224  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  78.1 
 
 
162 aa  224  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  72.96 
 
 
162 aa  222  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  72.96 
 
 
162 aa  222  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01295  NADH dehydrogenase subunit I  72.33 
 
 
162 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2823  NADH dehydrogenase subunit I  71.7 
 
 
162 aa  217  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0530625  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  65.62 
 
 
162 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  69.81 
 
 
166 aa  215  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  64.6 
 
 
161 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  69.18 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  63.75 
 
 
163 aa  213  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  67.7 
 
 
161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 
163 aa  207  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  64.29 
 
 
167 aa  205  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  63.75 
 
 
168 aa  204  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 
167 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  63.75 
 
 
163 aa  204  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  66.04 
 
 
162 aa  204  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
164 aa  203  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
164 aa  203  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 
162 aa  203  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 
167 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 
167 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  63.82 
 
 
163 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  62.11 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  62.11 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  63.23 
 
 
162 aa  198  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  60.87 
 
 
163 aa  198  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  61.04 
 
 
164 aa  197  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  59.75 
 
 
162 aa  197  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  63.23 
 
 
163 aa  196  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  61.94 
 
 
162 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  60.49 
 
 
162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  59.26 
 
 
162 aa  194  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  61.94 
 
 
163 aa  194  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  64.29 
 
 
224 aa  193  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 
163 aa  194  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  61.94 
 
 
163 aa  193  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  65.03 
 
 
273 aa  193  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  59.63 
 
 
163 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  58.64 
 
 
162 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  61.29 
 
 
162 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  60.65 
 
 
162 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  58.02 
 
 
162 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  61.29 
 
 
162 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  61.94 
 
 
162 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  60.38 
 
 
163 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  58.44 
 
 
226 aa  187  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  57.67 
 
 
169 aa  187  5.999999999999999e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 
162 aa  187  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 
162 aa  187  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 
162 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  60.81 
 
 
167 aa  184  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>