More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0853 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  98.45 
 
 		 194 aa  383  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  68.18 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  39.18 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  32.56 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  31.98 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  32.94 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  32.94 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  32.94 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  32.94 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  32.94 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  31.98 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 179 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  32.71 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.22 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  32.71 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  28.21 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  30.25 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  36.47 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  39.19 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  40 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  22.35 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  30.26 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  36.7 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  32.99 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  28.75 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  30 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  28.1 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  25.29 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  30.57 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  26.21 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  31.48 
 
 		 294 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  37.5 
 
 		 285 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  37.5 
 
 		 285 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  37.5 
 
 		 285 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  34.48 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  34.48 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>