More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0784 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  99.39 
 
 		 353 aa  651    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  83.33 
 
 		 330 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  66.15 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  67.54 
 
 		 320 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  54.85 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  52.2 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  52.48 
 
 		 322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  52.84 
 
 		 326 aa  311  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  53.68 
 
 		 328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  50.5 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.5 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.5 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.99 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  49.23 
 
 		 325 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  51.66 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  53.47 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.75 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  47.04 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.2 
 
 		 328 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  52.63 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  50.17 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.69 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  46.63 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  47.06 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  48.99 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  47.17 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  48.99 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.04 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.65 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  47.06 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.62 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  44.97 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  47.18 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  47.18 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  44.65 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  45.6 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.27 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.43 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.06 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  47.18 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  46.69 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.34 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.34 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  45.12 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  46.56 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  44.82 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  49.84 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.71 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  44.51 
 
 		 320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  47.83 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  46.42 
 
 		 323 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  45.81 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.62 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  47.32 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  47.89 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  42.77 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.41 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.3 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.33 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.33 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  45.72 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  45.72 
 
 		 322 aa  265  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.04 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.47 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.55 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.86 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.57 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  43.94 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  43.87 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  44.48 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  44.82 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.38 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.59 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.57 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.13 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.88 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.17 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.94 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.94 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  48.16 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  47.08 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.96 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 		 322 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.47 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  47.9 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.77 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.96 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.97 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  49.5 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.49 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.44 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.3 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.49 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  45.64 
 
 		 338 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  44.89 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.28 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.28 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>