More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0748 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  100 
 
 
447 aa  891    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  99.11 
 
 
447 aa  884    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  71.81 
 
 
447 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  71.59 
 
 
447 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  66.97 
 
 
446 aa  541  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  58.31 
 
 
446 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  55.03 
 
 
443 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  58.17 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  53.45 
 
 
446 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  51.68 
 
 
443 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  48.45 
 
 
445 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  47.65 
 
 
464 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  47 
 
 
444 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  47.72 
 
 
444 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  42.62 
 
 
434 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  41.45 
 
 
434 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  40.18 
 
 
438 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.44 
 
 
445 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  37.42 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  35.07 
 
 
440 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  39.6 
 
 
438 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  39.6 
 
 
438 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.01 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  35.95 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  36.9 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
489 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.6 
 
 
424 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  30.28 
 
 
419 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27 
 
 
419 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.1 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.53 
 
 
430 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  23.99 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  34.45 
 
 
450 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  32.84 
 
 
447 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.92 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  32.37 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  33.03 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  28.91 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.84 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.93 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.8 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  31.1 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  25.4 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  27.88 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  29.44 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  27.66 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.5 
 
 
425 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.28 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.96 
 
 
232 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  29.95 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  28.28 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.96 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  30.49 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  27.5 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.41 
 
 
675 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  28 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.53 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.03 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.31 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.11 
 
 
686 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.6 
 
 
254 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  28.5 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.36 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.27 
 
 
386 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  26.94 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.35 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  27.7 
 
 
393 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.69 
 
 
678 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  29.32 
 
 
691 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  26.18 
 
 
393 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.11 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  26.77 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  25.12 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.72 
 
 
687 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  24.32 
 
 
481 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  24.48 
 
 
365 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.53 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  26.58 
 
 
360 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  26.58 
 
 
360 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.52 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.67 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.15 
 
 
336 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  27.23 
 
 
355 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  22.66 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.54 
 
 
669 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  27.22 
 
 
606 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  27.22 
 
 
606 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.13 
 
 
684 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.13 
 
 
684 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.69 
 
 
375 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.43 
 
 
340 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  24.05 
 
 
381 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  25.91 
 
 
366 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  23.53 
 
 
232 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.6 
 
 
456 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  31.13 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.61 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  26.7 
 
 
393 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  26.59 
 
 
381 aa  60.1  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>