51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0651 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  99.55 
 
 
227 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  65.75 
 
 
217 aa  283  2e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  61.09 
 
 
282 aa  262  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  55.31 
 
 
233 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  52.91 
 
 
235 aa  217  9e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  53.57 
 
 
227 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  52.27 
 
 
226 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  55.86 
 
 
238 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.95 
 
 
232 aa  120  1e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33509e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  39.23 
 
 
215 aa  117  2e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  34.56 
 
 
240 aa  68.2  1e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  34.81 
 
 
247 aa  67.8  1e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  37.21 
 
 
240 aa  65.9  5e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  34.59 
 
 
228 aa  64.3  2e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  35.29 
 
 
234 aa  64.3  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85542e-07 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  39.34 
 
 
291 aa  53.5  2e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  31.16 
 
 
230 aa  53.1  3e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  35.58 
 
 
237 aa  51.6  1e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  42.65 
 
 
237 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  30.58 
 
 
242 aa  50.4  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  30.58 
 
 
242 aa  50.4  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  30.58 
 
 
242 aa  50.4  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  30.58 
 
 
242 aa  50.1  3e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  30.58 
 
 
242 aa  50.1  3e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  35.35 
 
 
253 aa  50.1  3e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  30.58 
 
 
242 aa  50.1  3e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  36 
 
 
202 aa  49.3  4e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  37.7 
 
 
250 aa  49.3  4e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  30.95 
 
 
242 aa  49.7  4e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  40.68 
 
 
222 aa  49.3  5e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  36.36 
 
 
239 aa  49.3  5e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  33.9 
 
 
229 aa  48.9  6e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  39.34 
 
 
204 aa  48.5  7e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  40.35 
 
 
206 aa  48.5  8e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  38.33 
 
 
225 aa  48.5  9e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  38.6 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  39.29 
 
 
224 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  39.29 
 
 
234 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  38.71 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  25 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  40 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  29.03 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  27.42 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  36.36 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  29.23 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  34.48 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  30.25 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  33.93 
 
 
212 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.92779e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  35.48 
 
 
259 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>