127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0607 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  68.42 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  67.94 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  60.31 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  74.04 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  54.2 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  53.44 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  56.82 
 
 		 140 aa  143  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  51.91 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  51.52 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  53.51 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  50.36 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  46.62 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  43.22 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  39.1 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  38.76 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  38.84 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  37.04 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  41.82 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  44.21 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  37.04 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  37.29 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  32.71 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  37.25 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  40.2 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  27.5 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  29.7 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  25.56 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  23.66 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4993  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37273  normal  0.0451267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  28.83 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  30.97 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  32.52 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  27.72 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  29.91 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  28.71 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  31.07 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  28.18 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  30.61 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  28.28 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  30.08 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  32.69 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  24.58 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  25.64 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  27.19 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  27.84 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  26.67 
 
 		 183 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  28.95 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  27.52 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  30.56 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  26.55 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  26.13 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  25.51 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  25.71 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  26.13 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  27.43 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  28.95 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  28.95 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  26.85 
 
 		 195 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26.32 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  32 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  30.77 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  27.35 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  25 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  37.8 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  27.19 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  27.34 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  31 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  31 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  24.77 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  25.44 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  30.19 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  27.27 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  27.19 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  26.85 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.85 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  31.53 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  27.52 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  29 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>